<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vavilov</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Вавиловский журнал генетики и селекции</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Vavilov Journal of Genetics and Breeding</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="epub">2500-3259</issn><publisher><publisher-name>Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the RAS</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vavilov-166</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ПОПУЛЯЦИЙ КРАСНОЙ ПОЛЕВКИ MYODES (= CLETHRIONOMYS) RUTILUS PALLAS, 1779 СЕВЕРНОГО ПРИОХОТЬЯ ПО ДАННЫМ ОБ ИЗМЕНЧИВОСТИ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ГЕНА ЦИТОХРОМА b МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>GENETIC STRUCTURE OF THE RED VOLE MYODES (= CLETHRIONOMYS) RUTILUS PALLAS, 1779 POPULATIONS OF THE NORTHERN PRIOKHOTYE WITH REGARD TO NUCLEOTIDE SEQUENCE VARIABILITY OF THE MTDNA CYTb GENE</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Переверзева</surname><given-names>В. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pereverzeva</surname><given-names>V. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Примак</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Primak</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Дубинин</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Dubinin</surname><given-names>E. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологических&#13;
проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук (ИБПС ДВО РАН), Магадан, Россия<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Institute of Ecological Problems of the North, Far East Branch, Russian Academy of Sciences,&#13;
Magadan, Russia<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2013</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>01</day><month>01</month><year>2015</year></pub-date><volume>17</volume><issue>3</issue><fpage>435</fpage><lpage>443</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А., 2015</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Pereverzeva V.V., Primak A.A., Dubinin E.A.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/166">https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/166</self-uri><abstract><p>Цель работы –изучение генетической структуры прибрежных популяций вида Myodes (= Сlethrionomys) rutilus Северного Приохотья на основании данных об изменчивости фрагмента гена цитохрома b мтДНК. Впервые определено нуклеотидное и гаплотипическое разнообразие строения гена цитохрома b и установлена генетическая структура популяций красных полевок островов Матыкиль, Недоразумения, Спафарьева и Талан (северная часть Охотского моря), полуострова Кони, окрестностей г. Магадана и бассейна р. Ямы. Островные популяции полевок обладают уникальными генофондами, в которые входят 2– гаплотипа. У M. rutilus материковой части побережья Охотского моря выявлен высокий уровень полиморфизма строения гена цитохрома b. Высказано предположение о существовании в Северном Приохотье единой береговой популяции красной полевки. Результаты генетического анализа свидетельствуют о принадлежности М. rutilus островов Тауйской губы и континентальной зоны побережья Охотского моря к одной материнской линии. Красные полевки о. Матыкиль залива Шелихова относятся к другой генетической ветви.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The purpose of the work was to determine the genetic structure of coastal populations of the species Myodes (=Clethrionomys) rutilus in the Northern Priokhotye on the base of the variability of a partial mt DNA cytb sequence. For the first time, the nucleotide and haplotypic variability of cytb gene, as well as the genetic structure of the red vole populations in Matykil, Nedorazumeniya, Spafar’eva and Talan islands (Northern Priokhotye ); Koni peninsula; the outskirts of Magadan; and the Yama river region were determined. The insular red vole populations have unique gene pools comprising two to three haplotypes. A high level of cytb gene polymorphism was found in M. rutilus from the continental coast of the Sea of Okhotsk. The existence of a contiguous coastal red vole population in the Northern Priokhotye is suggested. Genetic data evidence that М. rutilus from the islands of Tauysk Bay and the continental coast of the Sea of Okhotsk belong to the same maternal lineage, whereas the red vole from Matykil island pertains to another genetic branch.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>красная полевка</kwd><kwd>секвенирование мтДНК</kwd><kwd>цитохром b (cytb)</kwd><kwd>нуклеотидная последовательность</kwd><kwd>генетическая структура популяции</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>red vole</kwd><kwd>mtDNA sequencing</kwd><kwd>cytochrome b (cytb)</kwd><kwd>nucleotide sequence</kwd><kwd>genetic structure of a population</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Докл. АН СССР. 1976. Т. 231. № 1. С. 205–207.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Докл. АН СССР. 1976. Т. 231. № 1. С. 205–207.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Джикия Е.Л., Колесников А.А., Чудакова Д.А. и др. Генетический полиморфизм командорских популяций песцов // Генетика. 2007. Т. 43. № 9. С. 1239–1245.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Джикия Е.Л., Колесников А.А., Чудакова Д.А. и др. Генетический полиморфизм командорских популяций песцов // Генетика. 2007. Т. 43. № 9. С. 1239–1245.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Докучаев Н.Е., Иванов В.В., Засыпкин М.Ю., Примак А.А. Красные полевки (Clethrionomys rutilus Pallas, 1779) острова Матыкиль (северная часть Охотского моря) // Териологические исследования. Вып. 1. СПб., 2002. С. 140–142.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Докучаев Н.Е., Иванов В.В., Засыпкин М.Ю., Примак А.А. Красные полевки (Clethrionomys rutilus Pallas, 1779) острова Матыкиль (северная часть Охотского моря) // Териологические исследования. Вып. 1. СПб., 2002. С. 140–142.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Переверзева В.В., Засыпкин М.Ю., Соловенчук Л.Л. и др. Изменчивость гена цитохрома b митохондриальной ДНК в популяции красной полевки Сlethrionomys rutilus Pallas, 1779 поймы среднего течения реки Колымы // Изв. РАН. Сер. биол. 2011. № 3. С. 283–288.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Переверзева В.В., Засыпкин М.Ю., Соловенчук Л.Л. и др. Изменчивость гена цитохрома b митохондриальной ДНК в популяции красной полевки Сlethrionomys rutilus Pallas, 1779 поймы среднего течения реки Колымы // Изв. РАН. Сер. биол. 2011. № 3. С. 283–288.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Переверзева В.В., Лазуткин А.Н. Полиморфизм гена цитохрома b мтДНК красной полевки популяции поймы реки Буюнда // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2009. № 2. С. 84–89.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Переверзева В.В., Лазуткин А.Н. Полиморфизм гена цитохрома b мтДНК красной полевки популяции поймы реки Буюнда // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2009. № 2. С. 84–89.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Примак А.А., Засыпкин М.Ю. Аллозимная изменчивость и генетическая гетерогенность красной полевки Clethrionomys rutilus Pallas, 1779 некоторых островов северной части охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2011. № 2. С. 100–105.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Примак А.А., Засыпкин М.Ю. Аллозимная изменчивость и генетическая гетерогенность красной полевки Clethrionomys rutilus Pallas, 1779 некоторых островов северной части охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2011. № 2. С. 100–105.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чернявский Ф.Б. Млекопитающие крайнего северо-востока Сибири. М.: Наука, 1984. 392 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Чернявский Ф.Б. Млекопитающие крайнего северо-востока Сибири. М.: Наука, 1984. 392 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Avise J.C. Phylogeography: The History and Formation of Species. Harvard Univ. Press, 2000. 447 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Avise J.C. Phylogeography: The History and Formation of Species. Harvard Univ. Press, 2000. 447 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bandelt H.-J., Forster P., Rőhl A. Median-joining networks for inferring intraspecifi c phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. P. 37–48.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bandelt H.-J., Forster P., Rőhl A. Median-joining networks for inferring intraspecifi c phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. P. 37–48.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Excoffi er L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinformatics Online. 2005. V. 1. P. 47–50.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Excoffi er L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinformatics Online. 2005. V. 1. P. 47–50.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Fulgione D., Guglielmi S., Odierna G. et al. Morphological differentiation and genetic structure in island lizard populations // Zool. Sci. 2008. V. 25. P. 465–474.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Fulgione D., Guglielmi S., Odierna G. et al. Morphological differentiation and genetic structure in island lizard populations // Zool. Sci. 2008. V. 25. P. 465–474.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hassanin A., Lecointre G., Tiller S. Related articles, links abstract. The «evolutionary signal» of homoplasy in protein-coding gene sequences and its consequences for a priori weighting in phylogeny // C.R. Acad. Sci. 1998. V. 321. No. 7. Р. 611–620.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hassanin A., Lecointre G., Tiller S. Related articles, links abstract. The «evolutionary signal» of homoplasy in protein-coding gene sequences and its consequences for a priori weighting in phylogeny // C.R. Acad. Sci. 1998. V. 321. No. 7. Р. 611–620.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hinten G., Harriss F., Rossetto M., Braverstock P.R. Genetic variation and island biogeography: Microsatellite and mitochondrial DNA variation in island populations of the Australian bush rat, Rattus fuscipes greyii // Conserv. Genet. 2003. V. 4. P. 759–778.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hinten G., Harriss F., Rossetto M., Braverstock P.R. Genetic variation and island biogeography: Microsatellite and mitochondrial DNA variation in island populations of the Australian bush rat, Rattus fuscipes greyii // Conserv. Genet. 2003. V. 4. P. 759–778.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Rogers A.R. Genetic evidence for a Pleistocene population explosion // Evolution. 1995. V. 49. P. 608–615.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rogers A.R. Genetic evidence for a Pleistocene population explosion // Evolution. 1995. V. 49. P. 608–615.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA-5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA-5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wayne R.K., George S., Gilbert D. et al. Morphologic and genetic study of the island fox, Urocyon littoralis // Evolution. 1991. V. 5. P. 1849–1868.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wayne R.K., George S., Gilbert D. et al. Morphologic and genetic study of the island fox, Urocyon littoralis // Evolution. 1991. V. 5. P. 1849–1868.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
