<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vavilov</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Вавиловский журнал генетики и селекции</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Vavilov Journal of Genetics and Breeding</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="epub">2500-3259</issn><publisher><publisher-name>Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the RAS</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vavilov-167</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОТНОШЕНИЯ ПОПУЛЯЦИЙ КРАСНОЙ ПОЛЕВКИ MYODES (=CLETHRIONOMYS) RUTILUS PALLAS, 1779 СЕВЕРНОГО ПРИОХОТЬЯ И КОЛЫМСКОГО РЕГИОНА</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS AMONG POPULATIONS OF THE RED VOLE MYODES (= CLETHRIONOMYS) RUTILUS PALLAS, 1779 IN THE NORTHERN PRIOKHOTYE AND KOLYMA REGIONS</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Переверзева</surname><given-names>В. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pereverzeva</surname><given-names>V. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Примак</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Primak</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Дубинин</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Dubinin</surname><given-names>E. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vvpereverzeva@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологических&#13;
проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук (ИБПС ДВО РАН), Магадан, Россия<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Institute of Ecological Problems of the North, Far East Branch, Russian Academy of Sciences,&#13;
Magadan, Russia<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2013</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>01</day><month>01</month><year>2015</year></pub-date><volume>17</volume><issue>3</issue><fpage>444</fpage><lpage>451</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А., 2015</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Pereverzeva V.V., Primak A.A., Dubinin E.A.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/167">https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/167</self-uri><abstract><p>Цель работы –на основании анализа полиморфизма фрагмента гена цитохрома b мтДНК у представителей некоторых популяций Myodes (= Сlethrionomys) rutilus Северо-Востока Азии и Аляски определить филогенетические связи сообществ полевок Северного Приохотья и Колымского региона. Генетический анализ выявил различный уровень дифференциации между популяциями красных полевок бассейнов рек Колымы, Ямы и окрестностей г. Магадана. При этом гаплотипы полевок островных популяций Тауйской губы, материковой части Северного Приохотья и Колымского региона относятся к восточной линии с базальным вариантом гена В1. Гаплотипы представителей популяций Камчатки, Аляски и островов Матыкиль и Сахалин принадлежат к берингийской линии. Сибирские образцы значительно отличаются от представителей обеих указанных групп и являются связующим звеном между ними. Дифференциация популяций красной полевки в регионе и филогенетические отношения между группами могут быть следствием особенностей экспансии вида на Северо-Восток Азии в позднем плейстоцене. Первая волна расселения красной полевки по Берингийскому мосту суши достигла Северной Америки. В настоящее время представители этой ветви обитают на Аляске, Сахалине, Камчатке и о. Матыкиль. Повторно красная полевка проникла в регион в конце позднего плейстоцена. В результате второй волны заселения полевки восточной ветви заняли долину р. Колымы и побережье Охотского моря с некоторыми прилегающими островами.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The goal of the work was the determination of phylogenetic relationships in red vole associations of the Northern Priokhotye and Kolyma regions on the base of analysis of partial mtDNA cytb gene sequence polymorphism in some Myodes (Сlethrionomys) rutilus populations of Northeastern Asia and Alaska. Genetic analysis allowed the different levels of differentiation among red vole populations from the basins of Kolyma and Yama rivers and the suburbs of Magadan city to be determined. The haplotypes of red vole in the populations from islands of Tauysk Bay, the continental part of the Northern Priokhotye region, and the Kolyma region belong to the eastern lineage with the basal B1 gene variant. The haplotypes of representatives of populations from Kamchatka, Alaska, and Matykil and Sakhalin islands belong to the Beringean lineage. The Siberian samples differ significantly from the above lineages, being an interlink between them. The differentiation of red vole populations in the region and phylogenetic relationships among groups appear to be a consequence of certain features of the species expansion to the northeast in the Late Pleistocene. The first wave of red vole migrated to North America across the Bering land bridge. Presently the descendants of this wave inhabit Alaska, Sakhalin, Kamchatka, and Matykil island. For the second time, the red vole entered the region at the end of the Late Pleistocene. During the second wave of dispersal, red voles from the eastern branch occupied the drainage area of the Kolyma river and the coast of the Sea of Okhotsk together with some neighboring islands.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>красная полевка</kwd><kwd>секвенирование мтДНК</kwd><kwd>цитохром b (cytb)</kwd><kwd>нуклеотидная последовательность</kwd><kwd>филогенетические связи популяций</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>red vole</kwd><kwd>mtDNA sequencing</kwd><kwd>cytochrome b (cytb)</kwd><kwd>nucleotide sequence</kwd><kwd>phylogenetic relationships among populations</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Вангенгейм Э.А. Палеонтологическое обоснование стратиграфии антропогена Северной Азии (по млекопитающим). М.: Наука, 1977. 171 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Вангенгейм Э.А. Палеонтологическое обоснование стратиграфии антропогена Северной Азии (по млекопитающим). М.: Наука, 1977. 171 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Докл. АН СССР. 1976. Т. 231. № 1. С. 205–207.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Докл. АН СССР. 1976. Т. 231. № 1. С. 205–207.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Воскресенский С.С., Чанышева М.Н., Воскресенский И.С. и др. Плейстоценовые оледенения бассейна Колымы. Плейстоценовые оледенения Востока Азии. Магадан: СВКНИИ ДВНЦ АН СССР, 1984. С. 57–65.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Воскресенский С.С., Чанышева М.Н., Воскресенский И.С. и др. Плейстоценовые оледенения бассейна Колымы. Плейстоценовые оледенения Востока Азии. Магадан: СВКНИИ ДВНЦ АН СССР, 1984. С. 57–65.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Глушкова О.Ю. Морфология и палеогеография позднеплейстоценовых оледенений Северо-Востока СССР. Плейстоценовые оледенения Востока Азии. Магадан: СВКНИИ ДВНЦ АН СССР, 1984. С. 28–42.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Глушкова О.Ю. Морфология и палеогеография позднеплейстоценовых оледенений Северо-Востока СССР. Плейстоценовые оледенения Востока Азии. Магадан: СВКНИИ ДВНЦ АН СССР, 1984. С. 28–42.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН, 1995. Вып. 167. 522 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН, 1995. Вып. 167. 522 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Громов И.М., Поляков И.Я. Фауна СССР. Млекопитающие. Л.: Наука, 1977. Т. 3. Вып. 8. 504 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Громов И.М., Поляков И.Я. Фауна СССР. Млекопитающие. Л.: Наука, 1977. Т. 3. Вып. 8. 504 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Докучаев Н.Е., Иванов В.В., Засыпкин М.Ю., Примак А.А. Красные полевки (Clethrionomys rutilus Pallas, 1779) острова Матыкиль (северная часть Охотского моря) // Териологические исследования. Вып. 1. СПб., 2002. С. 140–142.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Докучаев Н.Е., Иванов В.В., Засыпкин М.Ю., Примак А.А. Красные полевки (Clethrionomys rutilus Pallas, 1779) острова Матыкиль (северная часть Охотского моря) // Териологические исследования. Вып. 1. СПб., 2002. С. 140–142.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Переверзева В.В., Засыпкин М.Ю., Соловенчук Л.Л. и др. Изменчивость гена цитохрома b митохондриальной ДНК в популяции красной полевки Сlethrionomys rutilus Pallas, 1779 поймы среднего течения реки Колымы // Изв. РАН. Сер. биол. 2011. № 3. С. 283–288.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Переверзева В.В., Засыпкин М.Ю., Соловенчук Л.Л. и др. Изменчивость гена цитохрома b митохондриальной ДНК в популяции красной полевки Сlethrionomys rutilus Pallas, 1779 поймы среднего течения реки Колымы // Изв. РАН. Сер. биол. 2011. № 3. С. 283–288.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А. Генетическая структура популяций красной полевки Myodes (= Clethrionomys) Rutilus Pallas, 1779 Северного Приохотья по данным об изменчивости нуклеотидных последовательностей гена цитохрома b митохондриальной ДНК // Вавилов. журн. генет. и селекции. 2013. Т. 17. № 3. С. 435–443.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Переверзева В.В., Примак А.А., Дубинин Е.А. Генетическая структура популяций красной полевки Myodes (= Clethrionomys) Rutilus Pallas, 1779 Северного Приохотья по данным об изменчивости нуклеотидных последовательностей гена цитохрома b митохондриальной ДНК // Вавилов. журн. генет. и селекции. 2013. Т. 17. № 3. С. 435–443.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Примак А.А., Засыпкин М.Ю. Аллозимная изменчивость и генетическая гетерогенность красной полевки Clethrionomys rutilus Pallas, 1779 некоторых островов северной части охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2011. № 2. С. 100–105.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Примак А.А., Засыпкин М.Ю. Аллозимная изменчивость и генетическая гетерогенность красной полевки Clethrionomys rutilus Pallas, 1779 некоторых островов северной части охотского моря // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2011. № 2. С. 100–105.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чернявский Ф.Б. Млекопитающие крайнего Северо-Востока Сибири. М.: Наука, 1984. 392 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Чернявский Ф.Б. Млекопитающие крайнего Северо-Востока Сибири. М.: Наука, 1984. 392 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Abramson N.I., Bodrov S.Yu. Genetic differentiation and phytogeography of Сlethrionomys rutilus Pallas 1811 inferred from variation of mitochondrial cytochrome b gene // 11th Intern. Conf. «Rodens et Spatium» on Rodent Biology. Myshkin, Russia, July 24–28. Moscow: VTO RAS, 2008. P. 64.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Abramson N.I., Bodrov S.Yu. Genetic differentiation and phytogeography of Сlethrionomys rutilus Pallas 1811 inferred from variation of mitochondrial cytochrome b gene // 11th Intern. Conf. «Rodens et Spatium» on Rodent Biology. Myshkin, Russia, July 24–28. Moscow: VTO RAS, 2008. P. 64.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bandelt H.-J., Forster P., Rőhl A. Median-joining networks for inferring intraspecifi c phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. P. 37–48.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bandelt H.-J., Forster P., Rőhl A. Median-joining networks for inferring intraspecifi c phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. P. 37–48.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cook J.A., Runck A.M., Conroy C.J. Historical biogeography at the crossroads of the northern continents: molecular phylogenetics of red-backed voles (Rodentia: Arvicolinae) // Mol. Phylogenetics and Evol. 2004. V. 30. P. 767–777.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cook J.A., Runck A.M., Conroy C.J. Historical biogeography at the crossroads of the northern continents: molecular phylogenetics of red-backed voles (Rodentia: Arvicolinae) // Mol. Phylogenetics and Evol. 2004. V. 30. P. 767–777.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Excoffi er L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinformatics Online. 2005. V. 1. P. 47–50.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Excoffi er L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinformatics Online. 2005. V. 1. P. 47–50.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hopkins D.M. Aspects of the Paleogeography of Beringia during the Late Pleistocene // Paleoecology. of Beringia. N.Y.: Acad. Press, 1982. P. 3–28.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hopkins D.M. Aspects of the Paleogeography of Beringia during the Late Pleistocene // Paleoecology. of Beringia. N.Y.: Acad. Press, 1982. P. 3–28.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Irwin D.М., Koche T.D., Wilson A.С. Evolution of the cytochrome b gene of Mammals // J. Mo1. Evol. 1991. No. 32. P. 128–144.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Irwin D.М., Koche T.D., Wilson A.С. Evolution of the cytochrome b gene of Mammals // J. Mo1. Evol. 1991. No. 32. P. 128–144.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Iwasa M.A., Kartavtseva I.V., Dobrotvorsky A.K. et al. Local differentiation of Clethrionomys rutilus in northeastern Asia inferred from mitochondrial gene sequences // Mamm. Biol. 2002. V. 67. P. 157–166.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Iwasa M.A., Kartavtseva I.V., Dobrotvorsky A.K. et al. Local differentiation of Clethrionomys rutilus in northeastern Asia inferred from mitochondrial gene sequences // Mamm. Biol. 2002. V. 67. P. 157–166.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Iwasa M.A., Kostenko V.A., Frisman L.V. et al. Phytogeography of the root vole Microtus oeconomus in Russian Far East: A special reference to comparison between Holarctic and Palearctic voles // Mammal Study. 2009. V. 34. P. 123–130.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Iwasa M.A., Kostenko V.A., Frisman L.V. et al. Phytogeography of the root vole Microtus oeconomus in Russian Far East: A special reference to comparison between Holarctic and Palearctic voles // Mammal Study. 2009. V. 34. P. 123–130.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Saitou N., Imanishi T. Relative effi ciencies of the Fitch-Margoliash, maximum-parsimony, maximum-likelihood, maximum-evolution, and neighbor-joining methods of phylogenetic tree construction in obstraining the correct tree // Mol. Biol. Evol. 1989. V. 6. P. 514–525.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Saitou N., Imanishi T. Relative effi ciencies of the Fitch-Margoliash, maximum-parsimony, maximum-likelihood, maximum-evolution, and neighbor-joining methods of phylogenetic tree construction in obstraining the correct tree // Mol. Biol. Evol. 1989. V. 6. P. 514–525.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tamura K., Peterson D. et al. MEGA-5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tamura K., Peterson D. et al. MEGA-5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
