Представлены классы сегрегационных моделей, описывающих характер наследования количественного признака, для расширенных нереципрокных диаллельных скрещиваний рекомбинантных инбредных линий. Отличительной особенностью данной работы являются использование многолокусного подхода и учет эпистатических взаимодействий групп локусов между собой. В построенных классах моделей производится поиск решений, которые с точностью до средовых шумов описывают экспериментальные данные. Далее выполняется анализ сцепления, т. е. определение положения модельных локусов найденных решений на генетической карте хромосом. Апробация процедуры поиска в пространстве моделей и подхода к анализу сцепления проводилась на реальных данных, где в качестве количественного признака выступала масса мозжечка лабораторных мышей. Дано краткое описание реализованного программного обеспечения.
This paper introduces classes of segregation models, which describe the inheritance of a quantitative trait, in extended diallelic recombinant inbred crosses. The distinctive feature of the method is usage of the multiple-QTL approach and incorporation of epistatic interactions of loci groups. Solutions that would describe experimental data set to an accuracy of environmental variance are sought in the constructed classes of models. Then linkage analysis is performed: model loci positions of the found solutions are mapped on chromosomes. The search procedure and linkage analysis have been tested with real data on cerebellum weight in laboratory mice as a quantitative trait. The developed software is briefly described.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.