vavilovВавиловский журнал генетики и селекцииVavilov Journal of Genetics and Breeding2500-3259Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the RASvavilov-239Research ArticleСтатьиArticlesСИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯАфонниковД. А.ada@bionet.nsc.ruМироноваВ. В.kviki@bionet.nsc.ruНовосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия; Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, РоссияРоссия201413012015181175182Copyright © Афонников Д.А., Миронова В.В., 20152015Афонников Д.А., Миронова В.В.Афонников Д.А., Миронова В.В.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/239

Первые попытки применения теории систем к биологии относятся к 30-м годам XX в. Так, в 1932 г. Уолтер Кэнон, декан факультета физиологии Гарвардского университета, в своей книге «Мудрость тела» («The wisdom of the body») описал термином «гомеостаз» способность организмов поддерживать большое число физиологических величин на постоянном уровне, несмотря на непрерывные изменения условий внешней среды. В 1943 г. американский математик Норберт Винер вместе с соавторами предположил, что отрицательные обратные связи могут играть центральную роль в поддержании стабильности живых систем, связав, тем самым, концепции контроля и оптимума с динамикой биологических систем.

В последние годы интерес к системному подходу в биологии был вызван прорывом в технологиях секвенирования и, как результат, расшифровке геномов, траскриптомов и протеомов человека и других организмов. Наличие мощных вычислительных ресурсов (суперкомпьютеров) и скоростных Интернет-соединений также значительно облегчило доступ к огромным массивам молекулярно-биологических данных и обеспечило возможность их анализа, что в значительной степени стало основанием для современной системной биологии. Об активном развитии этой области биологии в последнее время говорит следующий факт: количество статей, представленных PubMed и содержащих фразу «systems biology», увеличилось со 140 в 2003 г. до более 10 000 в 2013 г.

грант РФФИ-11-04-33112, грант фонда «Династия» для молодых биологов и Министерством образования и науки (договор №14.B25.31.0033)ReferencesКолчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А. Системная компьютерная биология. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2008.Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А. Системная компьютерная биология. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2008.Фадеев С.И. Минимизация свободной энергии Гиббса методом продолжения решения по параметру // Сплайны и их приложения. Вычислительные системы. 154. Сб. науч. тр. Новосибирск, 1995. С. 92–110.Фадеев С.И. Минимизация свободной энергии Гиббса методом продолжения решения по параметру // Сплайны и их приложения. Вычислительные системы. 154. Сб. науч. тр. Новосибирск, 1995. С. 92–110.Barabási A.L. Scale-free networks: a decade and beyond //Science. 2009. V. 325. No. 5939. P. 412–413.Barabási A.L. Scale-free networks: a decade and beyond //Science. 2009. V. 325. No. 5939. P. 412–413.Bodenstein C., Gosak M., Schuster S. et al. Modeling the seasonal adaptation of circadian clocks by changes in the network structure of the suprachiasmatic nucleus // PLoS Computat. Biol. 2012. V. 8. No. 9. e1002697.Bodenstein C., Gosak M., Schuster S. et al. Modeling the seasonal adaptation of circadian clocks by changes in the network structure of the suprachiasmatic nucleus // PLoS Computat. Biol. 2012. V. 8. No. 9. e1002697.Chung Y., Maharjan P.M., Lee O. et al. Auxin stimulates DWARF4 expression and brassinosteroid biosynthesis in Arabidopsis // Plant J. 2011. V. 66. No. 4. P. 564–578.Chung Y., Maharjan P.M., Lee O. et al. Auxin stimulates DWARF4 expression and brassinosteroid biosynthesis in Arabidopsis // Plant J. 2011. V. 66. No. 4. P. 564–578.Huang D.W., Sherman B.T., Lempicki R.A. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources // Nature Prot. 2008. V. 4. P. 44–57.Huang D.W., Sherman B.T., Lempicki R.A. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources // Nature Prot. 2008. V. 4. P. 44–57.Huang D.W., Sherman, B.T., Lempicki R.A. Bioinformatics enrichment tools: paths toward the comprehensive functional analysis of large gene lists // Nucl. Acids Res. 2009. V. 37. P. 1–13.Huang D.W., Sherman, B.T., Lempicki R.A. Bioinformatics enrichment tools: paths toward the comprehensive functional analysis of large gene lists // Nucl. Acids Res. 2009. V. 37. P. 1–13.Jeong H., Mason S.P., Barabási A.L., Oltvai Z.N. Lethality and centrality in protein networks // Nature. 2001. V. 411. No. 6833. P. 41–42.Jeong H., Mason S.P., Barabási A.L., Oltvai Z.N. Lethality and centrality in protein networks // Nature. 2001. V. 411. No. 6833. P. 41–42.Jönsson H., Heisler M.G., Shapiro B.E. et al. An auxin-driven polarized transport model for phyllotaxis // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006. V. 103. No. 5. P. 1633–1638.Jönsson H., Heisler M.G., Shapiro B.E. et al. An auxin-driven polarized transport model for phyllotaxis // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006. V. 103. No. 5. P. 1633–1638.Kang H., Han K., Choi M. Mathematical model for glucose regulation in the whole-body system // Islets. 2012. V. 4. No. 2. P. 84–93.Kang H., Han K., Choi M. Mathematical model for glucose regulation in the whole-body system // Islets. 2012. V. 4. No. 2. P. 84–93.Karp P.D. An ontology for biological function based on molecular interactions // Bioinformatics. 2000. V. 16. No. 3. P. 269–285.Karp P.D. An ontology for biological function based on molecular interactions // Bioinformatics. 2000. V. 16. No. 3. P. 269–285.Kitano H. Foundations of Systems Biology. Cambridge, MA: MIT Press, 2001.Kitano H. Foundations of Systems Biology. Cambridge, MA: MIT Press, 2001.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.