vavilovВавиловский журнал генетики и селекцииVavilov Journal of Genetics and Breeding2500-3259Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the RASvavilov-278Research ArticleСтатьиArticlesМИКРОСАТЕЛЛИТНОЕ ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ДОНСКИХ АБОРИГЕННЫХ СОРТОВ ВИНОГРАДА (VITIS VINIFERA L.)MICROSATELLITE GENOTYPING OF DON LOCAL GRAPE (VITIS VINIFERA L.) VARIETIESИльницкаяЕ. Т.IlnitskayaE. T.ilnitskaya79@mail.ruТокмаковС. В.TokmakovS. V.ilnitskaya79@mail.ruСупрунИ. И.SuprunI. I.ilnitskaya79@mail.ruГосударственное научное учреждение Северо-Кавказский зональный научно-исследовательский институт садоводства и виноградарства Россельхозакадемии, Краснодар, РоссияРоссияNorth Caucasian Zonal Research Institute for Horticulture and Viticulture, Russian Academy of Agricultural Sciences, Krasnodar, RussiaRussian Federation201418012015183523529Copyright © Ильницкая Е.Т., Токмаков С.В., Супрун И.И., 20152015Ильницкая Е.Т., Токмаков С.В., Супрун И.И.Ilnitskaya E.T., Tokmakov S.V., Suprun I.I.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/278

Местные аборигенные сорта – важная часть генофонда винограда. Получены ДНК-профили 11 аборигенных донских сортов винограда по микросателлитным локусам VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 и VrZAG79. Указанные SSR-маркеры рекомендованы союзом генетиков винограда как основные для генотипирования Vitis vinifera. В качестве референсных сортов в данной работе использованы Шардоне и Каберне-Совиньон. Маркеры были объединены в мультиплексные наборы, позволяющие анализировать по два локуса одновременно. Количество выявленных аллелей по локусам варьировало от 5 (VVS2, VMD7) до 11 (VVMD5) на локус в исследуемой выборке донских сортов винограда. Изученные сорта винограда обладают различными наборами аллельных комбинаций по проанализированным локусам. Кластерный анализ, проведенный по результатам генотипирования, показал, что наиболее генетически близки друг другу сорта Сибирьковый и Пухляковский белый.

Local traditional varieties constitute an important portion of grape genetic resources. DNA profiles for microsatellite loci VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62, and VrZAG79 were obtained for 11 local grape cultivars grown in the Don region. These SSR-markers are recommended as basic for Vitis vinifera genotyping. Chardonnay and Cabernet Sauvignon were used as reference cultivars. The markers were combined in multiple sets for simultaneous evaluation of two loci. The total number of different alleles per locus varied from 5 (VVS2, VMD7) to 11 (VVMD5) within the Don cultivars analyzed. The cultivars possessed different sets of allele combinations for loci under study. The genotyping results were subject to cluster analysis. Sibir’kovyi and Pukhlyakovskiy belyi showed the greatest proximity to each other. Molecular studies of local southern Russia grape cultivars will be continued.

Vitis viniferaаборигенные сортагенотипированиеSSR-маркерыVitis viniferalocal grape cultivarsSSR markersgenotypingРФФИ, администрация Краснодарского краяReferencesАлиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г. Происхождение донских сортов винограда // Виноделие и виноградарство. 2005. № 3. С. 36–37.Алиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г. Происхождение донских сортов винограда // Виноделие и виноградарство. 2005. № 3. С. 36–37.Алиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г., Ганич В.А. Донские аборигенные сорта винограда. Новочеркасск: Изд-во ЮРГТУ, 2006. 84 с.Алиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г., Ганич В.А. Донские аборигенные сорта винограда. Новочеркасск: Изд-во ЮРГТУ, 2006. 84 с.Девятова Н.М., Бельтюкова Н.Н., Назаров А.В. Анализ генетического разнообразия Poa pratensis L. в условиях нефтяного загрязнения почв с использованием IRАР-маркеров // Аграрн. вестн. Урала. 2011. № 1. С. 18–20.Девятова Н.М., Бельтюкова Н.Н., Назаров А.В. Анализ генетического разнообразия Poa pratensis L. в условиях нефтяного загрязнения почв с использованием IRАР-маркеров // Аграрн. вестн. Урала. 2011. № 1. С. 18–20.Турок Й., Маградзе Д.Н., Трошин Л.П. Сохранение генофонда евразийского винограда – первостепенная проблема европейских ампелографов // Науч. журн. КубГАУ [Электронный ресурс]. Краснодар: КубГАУ, 2006. № 01 (17). Режим доступа: http://www.ej.kubagro.ru/2006/01/19/Турок Й., Маградзе Д.Н., Трошин Л.П. Сохранение генофонда евразийского винограда – первостепенная проблема европейских ампелографов // Науч. журн. КубГАУ [Электронный ресурс]. Краснодар: КубГАУ, 2006. № 01 (17). Режим доступа: http://www.ej.kubagro.ru/2006/01/19/Шибата Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов // Молекуляр. клинич. диагностика. М.: Мир, 1999. С. 395–427.Шибата Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов // Молекуляр. клинич. диагностика. М.: Мир, 1999. С. 395–427.Bowers J.E., Dangl G.S., Vignani R., Meredith C.P. Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.) // Genome. 1996. V. 39. P. 628–633.Bowers J.E., Dangl G.S., Vignani R., Meredith C.P. Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.) // Genome. 1996. V. 39. P. 628–633.Dzhambazova T., Tsvetkov I., Atanassov I. et al. Genetic diversity in native Bulgarian grapevine germplasm (Vitis vinifera L.) based on nuclear and chloroplast microsatellite polymorphisms // Vitis. 2009. V. 48. No. 3. P. 115–121.Dzhambazova T., Tsvetkov I., Atanassov I. et al. Genetic diversity in native Bulgarian grapevine germplasm (Vitis vinifera L.) based on nuclear and chloroplast microsatellite polymorphisms // Vitis. 2009. V. 48. No. 3. P. 115–121.Ibanez J., Andres M.T., Molino A., Borrego J. Genetic study of key Spanish grapevine varieties using microsatellites analysis // Am. J. Enol. Vitic. 2003. V. 54. P. 22–29.Ibanez J., Andres M.T., Molino A., Borrego J. Genetic study of key Spanish grapevine varieties using microsatellites analysis // Am. J. Enol. Vitic. 2003. V. 54. P. 22–29.Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a Рnite population // Genetics (US). 1964. V. 49. P. 725–738.Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a Рnite population // Genetics (US). 1964. V. 49. P. 725–738.Martin J.P., Borrego J., Cabello F., Ortrız J.M. Characterization of Spanish grapevine cultivar diversity using sequencetagged microsatellite site markers // Genome. 2003. V. 46. P. 10–18.Martin J.P., Borrego J., Cabello F., Ortrız J.M. Characterization of Spanish grapevine cultivar diversity using sequencetagged microsatellite site markers // Genome. 2003. V. 46. P. 10–18.Martinez L.E., Cavagnaro P.F., Masuelli R.W., Zuniga M. SSR-based assessment of genetic diversity in South American Vitis vinifera varieties // Plant Sci. 2006. V. 170. P. 1036–1044.Martinez L.E., Cavagnaro P.F., Masuelli R.W., Zuniga M. SSR-based assessment of genetic diversity in South American Vitis vinifera varieties // Plant Sci. 2006. V. 170. P. 1036–1044.Nei M., Li W.-H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1979. V. 76. P. 5269–5273.Nei M., Li W.-H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1979. V. 76. P. 5269–5273.Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummifi ed plant tissues // Plant Mol. Biol. 1985. V. 19. No. 1. P. 69–76.Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummifi ed plant tissues // Plant Mol. Biol. 1985. V. 19. No. 1. P. 69–76.Schlotterer C., Soller M. Polymorphism and locus-specific effects on polymorphism at microsatellite loci in natural Drosophila melanogaster populations // Genetics. 1997. V.146. P. 309-320.Schlotterer C., Soller M. Polymorphism and locus-specific effects on polymorphism at microsatellite loci in natural Drosophila melanogaster populations // Genetics. 1997. V.146. P. 309-320.Stajneri N., Korosec-Korusa Z., Rusjan D., Javornic B. Microsatellite genotyping of old Slovenian grapevine varieties (Vitis vinifera L.) of the Primorje (coastal) winegrowing region // Vitis. 2008. V. 47. No. 4. P. 201–204.Stajneri N., Korosec-Korusa Z., Rusjan D., Javornic B. Microsatellite genotyping of old Slovenian grapevine varieties (Vitis vinifera L.) of the Primorje (coastal) winegrowing region // Vitis. 2008. V. 47. No. 4. P. 201–204.This P., Jung A., Boccacci P. et al. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identifi cation of grape cultivars // Theor. Appl. Genet. 2004. V. 109. P. 1448–1458.This P., Jung A., Boccacci P. et al. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identifi cation of grape cultivars // Theor. Appl. Genet. 2004. V. 109. P. 1448–1458.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.