Семейство генов дегидрогеназ коричного спирта вовлечено в ответ устойчивых и восприимчивых генотипов льна на заражение Fusarium oxysporum

Лен (Linum usitatissimum L.) используется для производства текстиля, масел, фармацевтических препаратов и композитных материалов. Крайне вредоносным заболеванием, снижающим урожайность льна, является фузариозное увядание, вызываемое грибом Fusarium oxysporum f. sp. lini. Созданы устойчивые к фузариозному увяданию сорта льна и определены гены, вовлеченные в ответ на F. oxysporum, однако механизмы устойчивости L. usitatissimum к этому патогену до сих пор неясны. В настоящем исследовании мы использовали данные секвенирования транскриптомов восприимчивых и устойчивых генотипов льна, выращенных в контрольных условиях или зараженных F. oxysporum. Проанализировано около 250 миллионов прочтений, полученных на секвенаторе NextSeq Illumina. После фильтрации прочтений для исключения транскриптома F. oxysporum оставшиеся прочтения картировали на геном L. usitatissimum и провели их количественный анализ. Оценили экспрессию генов семейства CAD, которые, как известно, участвуют в ответе на заражение F. oxysporum, у устойчивых и восприимчивых к фузариозному увяданию генотипов. Изменение экспрессии в ответ на возбудителя выявили для всех 13 исследованных генов CAD. Наиболее значительные различия в экспрессии между контрольными и инфицированными растениями наблюдались для генов CAD1B, CAD4A, CAD5A и CAD5B: сильное повышение экспрессии выявлено для CAD1B, CAD5A и CAD5B, а сильное снижение – для CAD4A. Для большинства генов CAD уровни экспрессии были близкими при одинаковых условиях вы- ращивания для всех изученных генотипов льна. Статистически значимое различие в изменении экспрессии между группами устойчивых и восприимчивых генотипов выявлено только для гена CAD1A. Наше исследование указывает на активное участие генов CAD в ответе растений льна на F. oxysporum, но не приводит свидетельств их роли в качестве кандидатов в гены устойчивости. Полученные результаты вносят вклад в понимание механизмов ответа льна на заражение F. oxysporum и роли генов CAD в устойчивости к стрессовым воздействиям.