ГЕНОМИКА
Аннотация
Формирование геномики как общепринятого научного направления приходится на первые годы XXI в. – время завершения проекта «Геном человека». Как и собственно классическая генетика, геномика занимается изучением структуры, функций и механизмов работы генов. Однако, если генетика интересуется отдельными генами (или наборами таких генов), вовлеченными в регуляцию конкретного биологического процесса, то геномика направлена на анализ структуры генома как целого и занимается изучением всей совокупности происходящих процессов и обеспечивающих их механизмов. Поэтому само возникновение геномики как отрасли научного знания было вызвано возможностью получения огромных объемов данных о нуклеотидных последовательностях и необходимостью быстрого и качественного анализа получаемой информации.
Об авторе
Г. В. Васильев
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия
Россия
Список литературы
1. Чеканов Н.Н., Булыгина Е.С., Белецкий А.В. Xарактеристика генома русского мужчины на основе анализа однонуклеотидных полиморфизмов и реконструкции последовательностей ДНК // Acta Naturae. 2010. Т. 2. С. 140–145.
2. Genomes Project Consortium. A map of human genome variation from population-scale sequencing // Nature. 2010. V. 467. P. 1061–1073.
3. Attanasio C., Nord A.S., Zhu Y. et al. Fine tuning of craniofacial morphology by distant-acting enhancers // Science. 2013. V. 342. P. 1241006.
4. Choulet F., Wicker T., Rustenholz C. et al. Megabase level sequencing reveals contrasted organization and evolution patterns of the wheat gene and transposable element spaces // Plant Cell. 2010. V. 22. P. 1686–1701.
5. Cuomo C.A., Desjardins C.A., Bakowski M.A. et al. Microsporidian genome analysis reveals evolutionary strategies for obligate intracellular growth // Genome Res. 2012. V. 22. P. 2478–2488.
6. Ecker J.R., Bickmore V.A., Barroso I. et al. Genomics: ENCODE explained // Nature. 2012. V. 489. P. 52–55.
7. Fleischmann R.D., Adams M.D., White O. et al. Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus infl uenzae Rd. // Science. 1995. V. 269. P. 496–512.
8. Gibson D., Glass J., Lartigue С. et al. Creation of a bacterial cell controlled by a chemically synthesized genome // Science. 2010. V. 329. P. 52–56.
9. Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 // Nature. 2006. V. 441. P. 315–321.
10. Gregory T.R. Synergy between sequence and size in large-scale genomics // Nat. Rev. Genet. 2005. V. 6. P. 699–708.
11. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. 2001. V. 409. P. 860–921.
12. Lazarev V.N., Levitskii S.A., Basovskii Y.I. et al. Complete genome and proteome of Acholeplasma laidlawii // J. Bacteriol. 2011. V. 193. P. 4943–4953.
13. Lindblad-Toh K., Garber M., Zuk O. et al. A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals // Nature. 2011. V. 478. P. 476–482.
14. Ng S., Turner E.H., Robertson P.D. et al. Targeted capture and massively parallel sequencing of twelve human exomes // Nature. 2009. V. 461. P. 272–276.
15. Ohno S. So much «junk» DNA in our genome // Brookhaven Symp. Biol. 1972. V. 23. P. 366–370.
16. Pace N.R., Delong E.F., Pace N.R. Analysis of a marine picoplankton community by 16S rRNA gene cloning and sequencing // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 4371–4378.
17. Pennisi E. Genomics. ENCODE project writes eulogy for junk DNA // Science. 2012. V. 337. P. 1159–1161.
18. Quail M., Smith M.E., Coupland P. et al. A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion torrent, pacifi c biosciences and illumina MiSeq sequencers // BMC Genomics. 2012. V. 13. P. 341.
19. Sanger F., Air G.M., Barrell B.G. et al. Nucleotide sequence of bacteriophage phi X174 DNA // Nature. 1977. V. 265. P. 687–695.
20. Segata N., Waldron L., Ballarini A. et al. Metagenomic microbial community profi ling using unique clade-specific marker genes // Nature Meth. 2012. V. 9. P. 811–814.
21. Schmutz J., Wheeler J., Grimwood J. et al. Quality assessment of the human genome sequence // Nature. 2004. V. 429. P. 365–368.
22. Veenstra J.A. Neurohormones and neuropeptides encoded by the genome of Lottia gigantea, with reference to other mollusks and insects // Gen. Comp. Endocrinol. 2010. V. 167. P. 86–103.
23. Venter J.C., Adams M.D., Myers E.W. et al. The sequence of the human genome // Science. 2001. V. 291. P. 1304–1351.
24. Wang Z., Liu X., Yang B.Z., Gelernter J. The role and challenges of exome sequencing in studies of human diseases // Front. Genet. 2013. V. 4. P. 160.
25. Wheeler D.A., Srinivasan M., Egholm M. et al. The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequencing // Nature. 2008. V. 452. P. 872–876.
Рецензия
Просмотров:
1358
Послать статью по эл. почте 