МИКРОСАТЕЛЛИТНОЕ ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ДОНСКИХ АБОРИГЕННЫХ СОРТОВ ВИНОГРАДА (VITIS VINIFERA L.)
Аннотация
Местные аборигенные сорта – важная часть генофонда винограда. Получены ДНК-профили 11 аборигенных донских сортов винограда по микросателлитным локусам VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 и VrZAG79. Указанные SSR-маркеры рекомендованы союзом генетиков винограда как основные для генотипирования Vitis vinifera. В качестве референсных сортов в данной работе использованы Шардоне и Каберне-Совиньон. Маркеры были объединены в мультиплексные наборы, позволяющие анализировать по два локуса одновременно. Количество выявленных аллелей по локусам варьировало от 5 (VVS2, VMD7) до 11 (VVMD5) на локус в исследуемой выборке донских сортов винограда. Изученные сорта винограда обладают различными наборами аллельных комбинаций по проанализированным локусам. Кластерный анализ, проведенный по результатам генотипирования, показал, что наиболее генетически близки друг другу сорта Сибирьковый и Пухляковский белый.
При поддержке: РФФИ, администрация Краснодарского края
Об авторах
Е. Т. Ильницкая
Государственное научное учреждение
Северо-Кавказский зональный научно-исследовательский институт
садоводства и виноградарства Россельхозакадемии, Краснодар, Россия
Россия
Россия
С. В. Токмаков
Государственное научное учреждение
Северо-Кавказский зональный научно-исследовательский институт
садоводства и виноградарства Россельхозакадемии, Краснодар, Россия
Россия
Россия
И. И. Супрун
Государственное научное учреждение
Северо-Кавказский зональный научно-исследовательский институт
садоводства и виноградарства Россельхозакадемии, Краснодар, Россия
Россия
Россия
Список литературы
1. Алиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г. Происхождение донских сортов винограда // Виноделие и виноградарство. 2005. № 3. С. 36–37.
2. Алиев А.М., Кравченко Л.В., Наумова Л.Г., Ганич В.А. Донские аборигенные сорта винограда. Новочеркасск: Изд-во ЮРГТУ, 2006. 84 с.
3. Девятова Н.М., Бельтюкова Н.Н., Назаров А.В. Анализ генетического разнообразия Poa pratensis L. в условиях нефтяного загрязнения почв с использованием IRАР-маркеров // Аграрн. вестн. Урала. 2011. № 1. С. 18–20.
4. Турок Й., Маградзе Д.Н., Трошин Л.П. Сохранение генофонда евразийского винограда – первостепенная проблема европейских ампелографов // Науч. журн. КубГАУ [Электронный ресурс]. Краснодар: КубГАУ, 2006. № 01 (17). Режим доступа: http://www.ej.kubagro.ru/2006/01/19/
5. Шибата Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов // Молекуляр. клинич. диагностика. М.: Мир, 1999. С. 395–427.
6. Bowers J.E., Dangl G.S., Vignani R., Meredith C.P. Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.) // Genome. 1996. V. 39. P. 628–633.
7. Dzhambazova T., Tsvetkov I., Atanassov I. et al. Genetic diversity in native Bulgarian grapevine germplasm (Vitis vinifera L.) based on nuclear and chloroplast microsatellite polymorphisms // Vitis. 2009. V. 48. No. 3. P. 115–121.
8. Ibanez J., Andres M.T., Molino A., Borrego J. Genetic study of key Spanish grapevine varieties using microsatellites analysis // Am. J. Enol. Vitic. 2003. V. 54. P. 22–29.
9. Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a Рnite population // Genetics (US). 1964. V. 49. P. 725–738.
10. Martin J.P., Borrego J., Cabello F., Ortrız J.M. Characterization of Spanish grapevine cultivar diversity using sequencetagged microsatellite site markers // Genome. 2003. V. 46. P. 10–18.
11. Martinez L.E., Cavagnaro P.F., Masuelli R.W., Zuniga M. SSR-based assessment of genetic diversity in South American Vitis vinifera varieties // Plant Sci. 2006. V. 170. P. 1036–1044.
12. Nei M., Li W.-H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1979. V. 76. P. 5269–5273.
13. Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummifi ed plant tissues // Plant Mol. Biol. 1985. V. 19. No. 1. P. 69–76.
14. Schlotterer C., Soller M. Polymorphism and locus-specific effects on polymorphism at microsatellite loci in natural Drosophila melanogaster populations // Genetics. 1997. V.146. P. 309-320.
15. Stajneri N., Korosec-Korusa Z., Rusjan D., Javornic B. Microsatellite genotyping of old Slovenian grapevine varieties (Vitis vinifera L.) of the Primorje (coastal) winegrowing region // Vitis. 2008. V. 47. No. 4. P. 201–204.
16. This P., Jung A., Boccacci P. et al. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identifi cation of grape cultivars // Theor. Appl. Genet. 2004. V. 109. P. 1448–1458.
Рецензия
Просмотров:
837
Послать статью по эл. почте 