Preview

Вавиловский журнал генетики и селекции

Расширенный поиск

Митохондриальный геном Dendrobaena tellermanica Perel, 1966 (Annelida: Lumbricidae)

https://doi.org/10.18699/VJGB-23-20

Аннотация

Дождевые черви – важная экологическая группа, которая оказывает значительное влияние как на состав почвенной фауны, так и на растительность. Генетическое разнообразие и филогения дождевых червей при этом остаются относительно слабо изученными. В настоящее время большинство работ по генетическому разнообразию дождевых червей основывается на единичных митохондриальных и ядерных генах. В связи с этим для реконструкции филогенетических отношений у дождевых червей перспективными становятся митохондриальные геномы. Почти все работы по этой теме посвящены видам из Западной Европы или Восточной Азии, другие регионы практически не затронуты. В настоящей работе мы провели секвенирование, сборку и анализ митохондриального генома Dendrobaena tellermanica Perel, 1966. Этот вид ранее входил в состав кавказского вида D. schmidti (Michaelsen, 1907) – политипического вида, в пределах которого выделяли множество таксонов. Геном был собран в виде одного контига длиной 15 298 п. н., содержащего типичный набор генов: 13 белок-кодирующих генов (три субъединицы цитохромоксидазы, семь субъединиц NADH дегидрогеназы, две субъединицы АТФ синтетазы, цитохром b), гены 12S и 16S рибосомальной РНК и 22 гена тРНК. Все гены были расположены на одной цепи ДНК. На контрольный регион, находящийся между генами tRNA-Arg и tRNA-His, приходилось 727 п. н. Контрольный регион содержал множество шпилек, а также тандемные повторы мономера AACGCTT. Филогенетический анализ на основе полных митохондриальных геномов показал, что род Dendrobaena является базальным в семействе Lumbricidae. D. tellermanica оказалась довольно далеким родственником космополитного вида D. octaedra, что говорит о высоком генетическом разнообразии в этом роде. Вид D. schmidti был парафилетичным по отношению к D. tellermanica. Поскольку для D. schmidti характерна очень высокая генетическая изменчивость, можно рассматривать эти данные как свидетельство в пользу разделения D. schmidti на несколько видов.

Просмотров: 655


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-3259 (Online)