Генетическая история коряков и эвенов Магаданской области по данным о полиморфизме Y-хромосомы

Для прояснения истории формирования генофондов коренного населения Северного Приохотья изучен полиморфизм Y-хромосомы у коряков и эвенов Магаданской области. Результаты исследования показали, что мужской генофонд коряков представлен гаплогруппами C-B90-B91, N-B202, Q-B143, распространенными также у других народов Северо-Востока Сибири преимущественно палеоазиатского происхождения. Для эвенов Магаданской области характерна высокая частота гаплогруппы C-B80, свойственной и для других тунгусо-маньчжурских народов. Общим компонентом генофондов коряков и эвенов являются гаплогруппы R-M17 и I-P37.2, унаследованные в результате метисации с пришлым восточноевропейским (преимущественно русским) населением. Высокая частота такого рода гаплогрупп Y-хромосомы у коряков (16.7 %) и эвенов (37.8 %) свидетельствует об интенсивных межэтнических контактах на протяжении последних столетий, и особенно, по всей видимости, в советское время. Причем генетический вклад со стороны европейских мужчин (по Y-хромосоме) существенно преобладает над таковым со стороны женщин (по митохондриальной ДНК). Исследование разнообразия гаплогрупп Y-хромосомы показало, что в генофонде коряков сохранились только относительно молодые филогенетические ветви. Возраст наиболее древнего компонента генофонда коряков (гаплогруппа C-B90-B91) оценивается примерно в 3.8 тыс. лет, возраст более молодых гаплогрупп Q-B143 и N-B202 составляет примерно 2.8 и 2.4 тыс. лет соответственно. Гаплогруппы C-B90-B91 и N-B202 являются сибирскими по происхождению, а гаплогруппа Q-B143, вероятно, унаследована предками коряков (и других палеоазиатских народов) от палеоэскимосов в результате их миграций на Северо-Восток Азии из Америки. Анализ микросателлитных локусов для гаплогруппы Q-B143 у эскимосов Гренландии, Канады и Аляски, а также у представителей коренного населения Северо-Востока Сибири выявил снижение генетического разнообразия с востока на запад, что указывает на направление распространения палеоэскимосского генетического компонента в циркумполярном регионе Америки и Азии. Эвены же появились в Северном Приохотье намного позже (в XVII в.) в результате экспансии тунгусских племен, что подтверждается данными анализа полиморфизма гаплогруппы C-B80.

1. Agdzhoyan A.T., Bogunov Y.V., Bogunova А.А., Kamenshikova E.N., Kagazezheva Zh.A., Korotkova N.A., Chernyshenko D.N., Ponomarev G.Y., Utrivan S.А., Koshel S.M., Balanovsky O.P., Balanovska E.V. The genetic portrait of the Okhotsk and the Kamchatka Evens population. Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seria XXIII. Antropologia = Moscow University Anthropology Bulletin. 2019;2: 116-125. DOI 10.32521/2074-8132.2019.2.116-125 (in Russian)

2. Agdzhoyan A.T., Bogunova А.А., Kamenshchikova E.N., Zaporozhchenko V.V., Bogunov Y.V., Balanovsky O.P., Balanovska E.V. The Chukchi of Kamchatka: a genetic portrait based on the wide array of Y-chromosome markers. Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seria XXIII. Antropologia = Moscow University Anthropology Bulletin. 2021;1:80-92. DOI 10.32521/2074-8132.2021.1.080-092 (in Russian)

3. Balanovska E.V., Bogunov Y.V., Kamenshikova E.N., Balaganskaya O.A., Agdzhoyan A.T., Bogunova A.A., Skhalyakho R.A., Alborova I.E., Zhabagin M.K., Koshel S.M., Daragan D.M., Borisova E.B., Galakhova A.A., Maltceva O.V., Mustafin Kh. Kh., Yankovsky N.K., Balanovsky O.P. Demographic and genetic portraits of the Ulchi population. Russian Journal of Genetics. 2018;54(10): 1245-1253. DOI 10.1134/S1022795418100046

4. Balanovska E.V., Bogunov Y.V., Bogunova A.A., Kamenshchikova E.N., Chernishenko D.N., Pylev V.Y., Balanovsky O.P., Lavryashina M.B. Demographic situation in Chukchi settlements from North Kamchatka. Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seria XXIII. Antropologia = Moscow University Anthropology Bulletin. 2020a; 1:87-97. DOI 10.32521/2074-8132.2020.1.087-097 (in Russian)

5. Balanovska E.V., Bogunov Y.V., Bogunova A.A., Kamenshchikova E.N., Pylev V.Y., Bychkovskaya L.S., Balanovsky O.P., Lavryashina M.B. Demographic portrait of Koryaks from Northern Kamchatka. Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seria XXIII. Antropologia = Moscow University Anthropology Bulletin. 2020b;4:111-122. DOI 10.32521/2074-8132.2020.4.111-122 (in Russian)

6. Balanovsky O., Rootsi S., Pshenichnov A., Kivisild T., Churnosov M., Evseeva I., Pocheshkhova E., Boldyreva M., Yankovsky N., Balanovska E., Villems R. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context. Am. J. Hum. Genet. 2008;82(1):236-250. DOI 10.1016/j.ajhg.2007.09.019

7. Ballantyne K.N., Goedbloed M., Fang R., Schaap O., Lao O., Wollstein A., Choi Y., van Duijn K., Vermeulen M., Brauer S., Decorte R., Poetsch M., von Wurmb-Schwark N., de Knijff P., Labuda D., Vézina H., Knoblauch H., Lessig R., Roewer L., Ploski R., Dobosz T., Henke L., Henke J., Furtado M.R., Kayser M. Mutability of Y-chromosomal microsatellites: rates, characteristics, molecular bases, and forensic implications. Am. J. Hum. Genet. 2010;87(3):341-353. DOI 10.1016/j.ajhg.2010.08.006

8. Bosch E., Calafell F., Rosser Z.H., Nørby S., Lynnerup N., Hurles M.E., Jobling M.A. High level of male-biased Scandinavian admixture in Greenlandic Inuit shown by Y-chromosomal analysis. Hum. Genet. 2003;112(4):353-363. DOI 10.1007/s00439-003-091

9. Burykin A.A. Traces of Eskimo culture on the coast of the Sea of Okhotsk according to archaeological, ethnographic, folkloristic and linguistic data. Sibirskaya Zaimka. 2001. URL: http://zaimka.ru/burykin-eskimos/ (Reference date: 01.09.2023). (in Russian)

10. Cardona A., Pagani L., Antao T., Lawson D.J., Eichstaedt C.A., Yngvadottir B., Shwe M.T.T., Wee J., Romero I.G., Raj S., Metspalu M., Villems R., Willerslev E., Tyler-Smith C., Malyarchuk B.A., Derenko M.V., Kivisild T. Genome-wide analysis of cold adaption in indigenous Siberian populations. PLoS One. 2014;9(5):e98076. DOI 10.1371/journal.pone.0098076

11. Derenko M.V., Malyarchuk B.A. Molecular Phylogeography of Northern Eurasia Populations Based on Mitochondrial DNA Variability Data. Magadan: Far Eastern Scientific Center, Far Eastern Branch of the RAS, 2010 (in Russian)

12. Derenko M., Malyarchuk B., Denisova G., Wozniak M., Dambueva I., Dorzhu C., Luzina F., Miscicka-Sliwka D., Zakharov I. Contrasting patterns of Y-chromosome variation in South Siberian populations from Baikal and Altay-Sayan regions. Hum. Genet. 2006;118(5): 591-604. DOI 10.1007/s00439-005-0076-y

13. Derenko M., Denisova G., Litvinov A., Dambueva I., Malyarchuk B. Mitogenomics of the Koryaks and Evens of the northern coast of the Sea of Okhotsk. J. Hum. Genet. 2023;68(10):705-712. DOI 10.1038/s10038-023-01173-x

14. Dulik M.C., Owings A.C., Gaieski J.B., Vilar M.G., Andre A., Lennie C., Mackenzie M.A., Kritsch I., Snowshoe S., Wright R., Martin J., Gibson N., Andrews T.D., Schurr T.G., Genographic Consortium. Y-chromosome analysis reveals genetic divergence and new founding native lineages in Athapaskan- and Eskimoan-speaking populations. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012;109(22):8471-8476. DOI 10.1073/pnas.1118760109

15. Fedorova S.A., Reidla M., Metspalu E., Metspalu M., Rootsi S., Tambets K., Trofimova N., Zhadanov S.I., Hooshiar Kashani B., Olivieri A., Voevoda M.I., Osipova L.P., Platonov F.A., Tomsky M.I., Khusnutdinova E.K., Torroni A., Villems R. Autosomal and uniparental portraits of the native populations of Sakha (Yakutia): implications for the peopling of Northeast Eurasia. BMC Evol. Biol. 2013;13:127. DOI 10.1186/1471-2148-13-127

16. Flegontov P., Altınışık N.E., Changmai P., Rohland N., Mallick S., Adamski N., Bolnick D.A., Broomandkhoshbacht N., Candilio F., Culleton B.J., Flegontova O., Friesen T.M., Jeong C., Harper T.K., Keating D., Kennett D.J., Kim A.M., Lamnidis T.C., Lawson A.M., Olalde I., Oppenheimer J., Potter B.A., Raff J., Sattler R.A., Skoglund P., Stewardson K., Vajda E.J., Vasilyev S., Veselovskaya E., Hayes M.G., O’Rourke D.H., Krause J., Pinhasi R., Reich D., Schiffels S. Palaeo-Eskimo genetic ancestry and the peopling of Chukotka and North America. Nature. 2019;570(7760):236-240. DOI 10.1038/s41586-019-1251-y

17. Gorin I., Balanovsky O., Kozlov O., Koshel S., Kostryukova E., Zhabagin M., Agdzhoyan A., Pylev V., Balanovska E. Determining the area of ancestral origin for individuals from North Eurasia based on 5,229 SNP markers. Front. Genet. 2022;13:902309. DOI 10.3389/fgene.2022.902309

18. Grebenyuk P.S., Fedorchenko A.Y., Lebedintsev A.I., Malyarchuk B.A. The ancient cultures of the extreme Northeast Asia and ethnogenetic reconstructions. Tomskiy Zhurnal Lingvisticheskikh i Antropologicheskikh Issledovaniy = Tomsk Journal of Linguistics and Anthropology. 2019;2(24):110-136. DOI 10.23951/2307-6119-2019-2-110-136 (in Russian)

19. Grugni V., Raveane A., Ongaro L., Battaglia V., Trombetta B., Colombo G., Capodiferro M.R., Olivieri A., Achilli A., Perego U.A., Motta J., Tribaldos M., Woodward S.R., Ferretti L., Cruciani F., Torroni A., Semino O. Analysis of the human Y-chromosome haplogroup Q characterizes ancient population movements in Eurasia and the Americas. BMC Biol. 2019;17(1):3. DOI 10.1186/s12915-018-0622-4

20. Ilumäe A.M., Reidla M., Chukhryaeva M., Järve M., Post H., Karmin M., Saag L., Agdzhoyan A., Kushniarevich A., Litvinov S., Ekomasova N., Tambets K., Metspalu E., Khusainova R., Yunusbayev B., Khusnutdinova E.K., Osipova L.P., Fedorova S., Utevska O., Koshel S., Balanovska E., Behar D.M., Balanovsky O., Kivisild T., Underhill P.A., Villems R., Rootsi S. Human Y chromosome haplogroup N: a non-trivial time-resolved phylogeography that cuts across language families. Am. J. Hum. Genet. 2016;99(1): 163-173. DOI 10.1016/j.ajhg.2016.05.025

21. Karafet T.M., Osipova L.P., Savina O.V., Hallmark B., Hammer M.F. Siberian genetic diversity reveals complex origins of the Samoyedic-speaking populations. Am. J. Hum. Biol. 2018;30(6):e23194. DOI 10.1002/ajhb.23194

22. Karmin M., Saag L., Järve M., Vicente M., Wilson Sayres M.A., Pagani L., DeGiorgio M., Talas U.G., Rootsi S., Ilumäe A.M., … Tyler-Smith C., Underhill P., Willerslev E., Nielsen R., Metspalu M., Villems R., Kivisild T. A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture. Genome Res. 2015; 25(4):459-466. DOI 10.1101/gr.186684.114

23. Kayser M., Krawczak M., Excoffier L., Dieltjes P., Corach D., Pascali V., Gehrig C., Bernini L.F., Jespersen J., Bakker E., Roewer L., de Knijff P. An extensive analysis of Y-chromosomal microsatellite haplotypes in globally dispersed human populations. Am. J. Hum. Genet. 2001;68(4):990-1018. DOI 10.1086/319510

24. Khakhovskaya L.N. Kamchadals of Magadan Oblast: history, culture, identification. Magadan: North-Eastern Interdisciplinary Research Institute, Far Eastern Branch of the RAS, 2003 (in Russian)

25. Luis J.R., Palencia-Madrid L., Garcia-Bertrand R., Herrera R.J. Bidirectional dispersals during the peopling of the North American Arctic. Sci. Rep. 2023;13(1):1268. DOI 10.1038/s41598-023-28384-8

26. Malyarchuk B., Derenko M., Denisova G., Maksimov A., Wozniak M., Grzybowski T., Dambueva I., Zakharov I. Ancient links between Siberians and Native Americans revealed by subtyping the Y chromosome haplogroup Q1a. J. Hum. Genet. 2011;56(8):583-588. DOI 10.1038/jhg.2011.64

27. Malyarchuk B., Derenko M., Denisova G., Khoit S., Wozniak M., Grzybowski T., Zakharov I. Y-chromosome diversity in the Kalmyks at the ethnical and tribal levels. J. Hum. Genet. 2013;58(12):804-811. DOI 10.1038/jhg.2013.108

28. Olofsson J.K., Pereira V., Børsting C., Morling N. Peopling of the north circumpolar region – insights from Y chromosome STR and SNP typing of Greenlanders. PLoS One. 2015;10(1):e0116573. DOI 10.1371/journal.pone.0116573

29. Pagani L., Lawson D.J., Jagoda E., Mörseburg A., Eriksson A., Mitt M., Clemente F., Hudjashov G., DeGiorgio M., Saag L., … Thomas M.G., Manica A., Nielsen R., Villems R., Willerslev E., Kivisild T., Metspalu M. Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia. Nature. 2016;538(7624):238-242. DOI 10.1038/nature19792

30. Pakendorf B., Novgorodov I.N., Osakovskij V.L., Danilova A.P., Protod’jakonov A.P., Stoneking M. Investigating the effects of prehistoric migrations in Siberia: genetic variation and the origins of Yakuts. Hum. Genet. 2006;120(3):334-353. DOI 10.1007/s00439-006-0213-2

31. Pugach I., Matveev R., Spitsyn V., Makarov S., Novgorodov I., Osakovsky V., Stoneking M., Pakendorf B. The complex admixture history and recent southern origins of Siberian populations. Mol. Biol. Evol. 2016;33(7):1777-1795. DOI 10.1093/molbev/msw055

32. Raghavan M., Skoglund P., Graf K.E., Metspalu M., Albrechtsen A., Moltke I., Rasmussen S., Stafford T.W., Jr., Orlando L., Metspalu E., Karmin M., Tambets K., Rootsi S., Mägi R., Campos P.F., Balanovska E., Balanovsky O., Khusnutdinova E., Litvinov S., Osipova L.P., Fedorova S.A., Voevoda M.I., DeGiorgio M., Sicheritz-Ponten T., Brunak S., Demeshchenko S., Kivisild T., Villems R., Nielsen R., Jakobsson M., Willerslev E. Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans. Nature. 2014; 505(7481):87-91. DOI 10.1038/nature12736

33. Rasmussen M., Li Y., Lindgreen S., Pedersen J.S., Albrechtsen A., Moltke I., Metspalu M., Metspalu E., Kivisild T., Gupta R., … Brunak S., Sicheritz-Pontén T., Villems R., Nielsen R., Krogh A., Wang J., Willerslev E. Ancient human genome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo. Nature. 2010;463(7282):757-762. DOI 10.1038/nature08835

34. Rubicz R., Zlojutro M., Sun G., Spitsyn V., Deka R., Young K.L., Crawford M.H. Genetic architecture of a small, recently aggregated Aleut population: Bering Island, Russia. Hum. Biol. 2010;82(5-6): 719-736. DOI 10.1353/hub.2010.a408138

35. Sikora M., Pitulko V., Sousa V., Allentoft M.E., Vinner L., Rasmussen S., Margaryan A., de Barros Damgaard P., de la Fuente Castro C., Renaud G., … Sajantila A., Lahr M.M., Durbin R., Nielsen R., Meltzer D., Excoffier L., Willerslev E. The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene. Nature. 2019;570(7760):182-188. DOI 10.1038/s41586-019-1279-z

36. Solovyev A.V., Borisova T.V., Romanov G.P., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Nikitina S.E., Alekseev A.N., Barashkov N.A., Fedorova S.A. Genetic history of Russian Old-Settlers of the Arctic coast of Yakutia from the settlement of Russkoye Ust’ye inferred from Y chromosome data and genome-wide analysis. Russian Journal of Genetics. 2023;59(9):949-955. DOI 10.1134/S1022795423090119

37. Yu H.-X., Ao C., Zhang X.-P., Liu K.-J., Wang Y.-B., Meng S.-L., Li H., Wei L.-H., Man D. Unveiling 2,000 years of differentiation among Tungusic-speaking populations: a revised phylogeny of the paternal founder lineage C2a-M48-SK1061. Front. Genet. 2023;14:1243730. DOI 10.3389/fgene.2023.1243730

38. Zhivotovsky L.A., Underhill P.A., Cinnioğlu C., Kayser M., Morar B., Kivisild T., Scozzari R., Cruciani F., Destro-Bisol G., Spedini G., Chambers G.K., Herrera R.J., Yong K.K., Gresham D., Tournev I., Feldman M.W., Kalaydjieva L. The effective mutation rate at Y chromosome short tandem repeats, with application to human population-divergence time. Am. J. Hum. Genet. 2004;74(1):50-61. DOI 10.1086/380911