РАЗРАБОТКА ПРОСТРАНСТВЕННО РАСПРЕДЕЛЕННОЙ МОДЕЛИ ЭВОЛЮЦИИ ПРОКАРИОТИЧЕСКИХ СООБЩЕСТВ

Полный текст:


Аннотация

В статье описаны методика моделирования функционирования и эволюции прокариотических сообществ и программный комплекс «Гаплоидный эволюционный конструктор» (http://evol-constructor.bionet.nsc.ru) для построения моделей с пространственным распределением по одной координате (1D). Приведено сравнение 0D (с полным перемешиванием) и 1D моделей прокариотического сообщества вида «отравитель–жертва». Показано влияние пространственного распределения субстратов и прокариотических клеток на стабильность сообщества.


Об авторах

С. А. Лашин
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, Россия Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия
Россия


Е. А. Мамонтова
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, Россия Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия
Россия


Ю. Г. Матушкин
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, Россия Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия
Россия


Список литературы

1. Бандман О.Л. Клеточно-автоматные модели пространственной динамики // Системная информатика. 2006. Вып. 10. С. 59–113.

2. Левченко В.Ф. Эволюция биосферы до и после появления человека. СПб: Ин-т эволюционной физиологии и биохимии РАН, 2003. 164 с.

3. Разумовский С.М. Закономерности динамики биоценозов. М.: Наука, 1981. 231 с.

4. Раутиан А.С., Жерихин В.В. Модели филоценогенеза и уроки экологических кризисов геологического прошлого // Журн. общ. биологии. 1997. Т. 58. Вып. 4. С. 20–47.

5. Ризниченко Г.Ю. Математические модели в биофизике и экологии. М.; Ижевск: Институт компьютерных исследований, 2003. 184 с.

6. Хлопков Ю.И. Статистическое моделирование в вычислительной аэродинамике. М.: ООО «Азбука-2000», 2006. 158 с.

7. Bird G.A. Shock-wave structure in rigid sphere gas // Rarefied Gas Dynamics. 1965. V. 1. P. 216–222.

8. Haviland J.K., Lavin M.D. Application of the Monte-Karlo method to heat hauster in rarefi ed of gases // Phys. Fluids. 1962. V. 5. Nо. 11. P. 1399–1405.

9. Herbert D. Recent progress in microbiology. Oxford: Blackwell, 1958. P. 381–416.

10. Lashin S.A., Matushkin Yu.G. Haploid evolutionary constructor: new features and further challenges // In Silico. Biol. 2012. V. 11. Nо. 3. P. 125–135.

11. Lashin S.A., Suslov V.V., Matushkin Yu.G. Comparative modeling of coevolution in communities of unicellular organisms: adaptability and biodiversity // J. Bioinform. and Computat. Biol. 2010. V. 8. Nо. 3. Р. 627–643.

12. Monod J. Recherches sur la croissanse des cultures bacteriennes. P.: Hermann, 1942.

13. Rübel A.E. Ecology, plant geography, and geobotany: their history and aim // Bot. Gaz. 1927. V. 84. No. 4. P. 428–439.


Дополнительные файлы

Просмотров: 72

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-0462 (Print)
ISSN 2500-3259 (Online)