МИГРАЦИИ КАК ПРИЧИНА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ОДНОРОДНОСТИ ТИХООКЕАНСКОЙ СЕЛЬДИ (CLUPEA PALLASII) ОХОТСКОГО МОРЯ
Аннотация
С применением параметров молекулярной изменчивости, рассчитанных на основании сравнения последовательностей контрольного региона митохондриальной ДНК (мтДНК), не выявлено дифференциации между выборками нерестовой сельди из различных частей Охотского моря (p > 0,05). Отсутствие дифференциации может быть приписано постоянному потоку генов между стадами, причем величину потока мигрантов (Nm) возможно установить только косвенным образом. Анализ суммарной молекулярной изменчивости (global AMOVA) показал, что при объединении всех исследованных выборок или при попарном их объединении на межвыборочный компонент приходится примерно от 0,1 до 0,2 % полиморфизма при высоком уровне значимости (p > 0,1), что может быть расценено как следствие влияния интенсивных миграций. При оценке минимальной доли мигрантов установлено, что их количество составляет 3,6–,5 % за год на локальность.
Ключевые слова
тихоокеанская сельдь,
Clupea pallasii,
Охотское море,
мтДНК,
контрольный регион,
популяционная структура,
поток генов
При поддержке: А.А.Смирнов, А.Г. Лапинский, рецензент "Вавиловского журнала генетики и селекции»
Об авторе
В. В. Горбачев
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук
Россия
Россия
Список литературы
1. Амброз А.И. Характеристика уловов сельди в заливе Де-Кастри за 1929 год // Рыбное хозяйство Дальнего Востока. 1930. № 7/8. С. 38–43.
2. Андреев В.Л. Результаты мечения сельди в заливе Ныйво (северо-восточный Сахалин) в 1963 году // Изв. ТИНРО. 1968. Т. 65. С. 257–258.
3. Аюшин Б.И. Некоторые данные о нагульной сельди северной части Охотского моря // Изв. ТИНРО. 1951. Т. 35. С. 81–86.
4. Горбачев В.В., Соловенчук Л.Л., Черноиванова Л.А. Внутривидовая структура тихоокеанской сельди Clupea pallasii Valenciennes, 1847 (Clupeidae: Clupeiformes) Японского и южной части Охотского морей по данным об изменчивости контрольного региона митохондриальной ДНК // Биология моря. 2011. Т. 37. № 6. С. 472–476.
5. Калчугин П.В., Вдовин А.Н. Некоторые аспекты внутривидовой дифференциации тихоокеанской сельди (Clupea pallasi) в водах Приморья // Изв. ТИНРО. 2000. Т. 127. С. 166–170.
6. Лапинский А.Г., Смирнов А.А., Горбачев В.В., Соловенчук Л.Л. Генетическая дифференциация североохото-морской группировки тихоокеанской сельди Clupea pallasi Valenciennes, 1847 (Clupeidae; Clupeiformes), по данным RAPD // Вопросы рыболовства. 2008. Т. 9. № 1 (33). С. 128–137.
7. Науменко Н.И. Биология и промысел морских сельдей Дальнего Востока. Петропавловск-Камчатский: Камчатский печатный двор, 2001. 330 с.
8. Пискунов И.А. Материалы по биологии сельди Гижигинской губы // Изв. ТИНРО. 1954. Т. 39. С. 59–72.
9. Правоторова Е.П. О районах нагула гижигинско-камчатского стада сельди // Рыбное хозяйство. 1963. № 12. С. 14–17.
10. Рыбникова И.Г. Популяционно-генетическая структура сельдей Охотского моря // Сельдевые северной части Тихого океана. Владивосток: Известия ТИНРО, 1985. С. 57–62.
11. Смирнов А.А., Марченко С.Л., Кащенко Е.В. Оценка популяционного статуса сельди Тауйской губы Охотского моря по результатам морфометрического анализа 2001–2002 гг. // Тез. докл. VI науч. конф. «Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей». Петропавловск-Камчатский: Камчатпресс, 2005. С. 253–255.
12. Тюрнин Б.В. Нерестовый ареал охотской сельди // Изв. ТИНРО. 1973. Т. 86. С. 12–21.
13. Aris-Brosou S., Excoffi er L. The impact of population expansion and mutation rate heterogeneity on DNA sequence polymorphism // Mol. Biol. Evol. 1996. V. 13. P. 494–504.
14. Avise J.C. Phylogeography: The History and Formation of Species. 2000. 447 p.
15. Bandelt H., Forster P., Rőhl A. Median-joining networks for inferring intraspecifi c phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. P. 37–48.
16. Excoffi er L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evolutionary Bioinformatics Online. 2005. V. 1. P. 47–50.
17. Fu Y. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth, hitchhiking and backgroud selection // Genetics. 1997. V. 147. P. 915–925.
18. Gaggiotti O., Excoffi er L. A simple method of removing the effect of a bottleneck and unequal population sizes on pairwise genetic distances // Proc. of the Royal Soc. London. 2000. V. 267. P. 81–87.
19. Hay D.E., McCarter P.B., Daniel K.S. Tagging of Pacifi c herring Clupea pallasi from 1936–1992: a review with comments on homing, geographic fi delity, and straying // Can. J. Fisheries Aquat. Sci. 2001. V. 58. P. 1356–1370.
20. Mantel N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach // Cancer Res. 1967. V. 27. 209–220.
21. Ray N., Currat M., Excoffi er L. Intra – deme molecular diversity in spatially expanding populations // Mol. Biol. Evol. 2003. V. 20 (1). P. 76–86.
22. Slatkin M. A measure of population subdivision based on microsatellite allele frequencies // Genetics. 1995. V. 139. P. 457–462.
23. Schneider S., Excoffi er L. Estimation of demographic parameters from the distribution of pairwise differences when the mutation rates vary among sites: Application to human mitochondrial
24. DNA // Genetics. 1999. No. 152. P. 1079–1089.
25. Tajima F. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism // Genetics. 1989a. V. 122. P. 585–595.
26. Tajima F. The effect of change in population size on DNA polymorphism // Genetics 1989b. V. 123. P. 597–601.
27. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. 2007. V. 24. P. 1596–1599.
28. Weir B.S. Genetic Data Analysis II: Methods for Discrete Population Genetic Data. Sinauer Assoc., Inc., Sunderland, MA, USA. 1996. 376 p.
29. Weir B.S., Hill W.G. Estimating F – statistics // Ann. Rev Genet. 2002. V. 36. P. 721–750.
30. Wright S. The genetical structure of population // Ann. Eugen. 1951. V. 15. P. 323–354.
31. Whitehead P. Clupeoid fi shes of the world (Suborder Clupeoidei). An Annotated and Illustrated Catalogue of the Herrings, Sardines, Pilchards, Sprats, Shads, Anchovies and Wolf-herrings. 1985. V. 125/7(1). 303 p.
Рецензия
Просмотров:
583
Послать статью по эл. почте 