Полиморфизм T3111C гена Clock у женщин русской и бурятской национальности

В двух выборках женщин климактерического возраста русской и бурятской национальности, проживающих в Восточной Сибири (Иркутская область, г. Иркутск и Республика Бурятия, г. Улан-Удэ), изучена распространенность генотипов и аллелей T3111C полиморфизма гена циркадного ритма Clock (rs1801260). Для этого было проведено генотипирование образцов ДНК методом полимеразной цепной реакции. Показано, что сравниваемые группы статистически значимо отличаются по частоте встречаемости генотипов (р = 0.001). Обнаружено, что в выборке русских женщин больше частота TC генотипа (р = 0.004) и меньше частота TT генотипа (р = 0.0001) по сравнению с выборкой женщин из Бурятии. Аллель с измененной последовательностью 3111С у русских женщин встречался в 30.4 % случаев, что статистически значимо чаще по сравнению с выборкой бурят, где доля аллеля 3111С составила 19.3 % (p = 0.014).

циркадный ритм, гены, полиморфизм, популяция

1. Bairova T.A., Dolgikh V.V., Kolesnikova L.I., Pervushina O.A. Nutriciogenetics and risk factors of cardiovascular disorders: an association study in Eastern Siberia populations. Acta Biomedica Scientifica. 2013;4(92):87-92. (in Russian)

2. Bairova T.A., Kolesnikov S.I., Kolesnikova L.I., Pervushina O.A., Darenskaya M.A., Grebenkina L.A. Lipid peroxidation and mitochondrial superoxide dismutase-2 gene in adolescents with essential hypertension. Byulleten eksperimentalnoy biologii i meditsiny = Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2014;8(158):141144. DOI 10.1007/s10517-014-2717-4. (in Russian)

3. Chernysheva M.P. Circadian oscillators and normones. Tsitologiya = Cytology. 2013;11(55):761-777. (in Russian)

4. Corella D., Asensio E.M., Coltell O., Sorli J.V., Estruch R., MartinezGonzalez M.A., Salas-Salvado J., Castaner O., Aros F., Lapetra J., Serra-Majem L., Gomes-Gracia E., Ortega-Azorin C., Fiol M., Espino J.D., Diaz-Lopez A., Fito M., Ros M., Ordavas J.M. CLOCK gene variation is associated with incidence of type-2 diabetes and cardiovascular diseases in type-2 diabetic subjects: dietary modulation in the PREDIMED randomized trial. Cardiovasc. Diabetol. 2016;15(4):1-12. DOI 10.1186/s12933-015-0327-8.

5. Dibner C., Schibler U. Circadian timing of metabolism in animal models and humans. J. Intern. Med. 2015;277(5):513-527. DOI 10.1111/ joim.12347.

6. Dunlap J.C. Molecular bases for circadian clocks. Cell. 1999;96(2): 271-290.

7. Fu L., Lee C.C. The circadian clock: pacemaker and tumor suppressor. Nat. Rev. Cancer. 2003;3:350-361. DOI 10.1038/nrc1072.

8. Kolesnikova L.I., Madaeva I.M., Semenova N.V., Suturina L.V., Berdina O.N., Sholohov L.F., Solodova E.I. Pathogenic role of melatonin in sleep disorders in menopausal women. Bull. Exp. Biol. Med. 2013;156(1):104-106.

9. Kolchanov N.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Likhoshvai V.A., Matushkin Yu.G. Gene Networks. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2013;17(4/2):833-850. (in Russian)

10. Kolomeichuk S.N., Makeeva I.V., Topchieva L.V., Korneva V.A., Nemova N.N. Association of T3111C polymorphism in the 3ʹ-untranslated region of the Clock gene with the risk of essential arterial hypertension and coronary artery disease in the Russian population (residents of Karelia). Genetika = Genetics (Moscow). 2011;47(10):1411-1415. DOI 10.7868/S001667581604010X. (in Russian)

11. Kowalska E., Moriggi E., Bauer C., Dibner C., Brown S.A. The circadian clock starts ticking at a developmentally early stage. J. Biol. Rhythms. 2010;25:442-449. DOI 10.1177/0748730410385281.

12. Krystal A.D., Edinger J., Wohlgemuth W., Marsh G.R. Sleep in perimenopausal and post-menopausal women. Sleep Med. Rev. 1998; 4(2):243-253.

13. Loria-Kohen V., Espinosa-Salinas I., Marcos-Pasero H., LourençoNogueira T., Herranz J., Molina S., Reglero G., Ramirez de Molina A. Polymorphism in the CLOCK gene may influence the effect of fat intake reduction on weight loss. Nutrition. 2016;32(4):453460. DOI 10.1016/j.nut.2015.10.013.

14. Lowrey P.L., Shimomura K., Antoch M.P., Yamazaki S., Zemenides P.D., Ralph M.R., Menaker M., Takahashi J.S. Positional syntenic cloning and functional characterization of the mammalian circadian mutation tau. Science. 2000;288(5465):483-492.

15. Madayeva I.M., Berdina O.N., Kolesnikova L.I., Bairova T.A., Ablamskaya O.N., Madaev V.V., Antonenko F.F. Ethnic features of sleep disorders in Eastern Siberia. Acta Biomedica Scientifica. 2013; 4(92):51-55. (in Russian)

16. Madayeva I.M., Semenova N.V., Danusevich I.N., Kolesnikova L.I. Climacteric syndrome, sleep disorders, and melatonin. Effektivnaya farmakoterapiya = Effective Pharmacotherapy. 2016;19:86-93. (in Russian)

17. Owens J.F., Matthews K.A. Sleep disturbance in healthy middle-aged women. Maturitas. 1998;30(1):41-50. Ozburn A.R., Purohit K., Parekh P.K., Kaplan G.N., Falcon E., Mukherjee S., Cates H.M., McClung C.A. Functional implications of the CLOCK 3111T/C single-nucleotide polymorphism. Front. Psychiatry. 2016;7(67):1-8. DOI 10.3389/fpsyt.2016.00067.

18. Pagani L., Semenova E.A., Moriggi E., Revell V.L., Hack L.M., Lockley S.W., Arendt J., Skene D.J., Meier F., Izakovic J., WirzJustice A., Cajochen C., Sergeeva O.J., Cheresiz S.V., Danilenko K.V., Eckert A., Brown S.A. The physiological period length of the human circadian clock in vivo is directly proportional to period in human fibroblasts. PLoS ONE. 2010; 5(10):1-17. DOI 10.1371/ journal.pone. 0013376.

19. Schmidt C., Peigneux P., Cajochen C. Age-related changes in sleep and circadian rhythms: impact on cognitive performance and underlying neuroanatomical networks. Front. Neurol. 2012;3(118):111. DOI 10.3389/fneur.2012.00118.

20. Solovyov I.A., Dobrovol’skaya E.V., Moskalev A.A. Genetic control of circadian rhythms and aging. Genetika = Genetics (Moscow). 2016; 52(4):393-413. DOI 10.7868/S001667581604010X. (in Russian)

21. Zhang B., Wing Y.K. Sex differences in insomnia: a meta-analysis. Sleep. 2006;29(1):85-93.

22. http://www.genecards.org

23. http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Variation/Population