Послать статью по эл. почте 
БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА ШТАММА Geobacillus stearothermophilus 22, ВЫДЕЛЕННОГО ИЗ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА (ПРИБАЙКАЛЬЕ)
Аннотация
Новый штамм Geobacillus stearothermophilus 22 был выделен из термального источника Гарга, расположенного в Баргузинской долине Прибайкалья. Были проанализированы морфологические и биохимические особенности G. stearothermophilus 22, проведено полногеномное секвенирование с последующим биоинформатическим анализом. Показана высокая степень сходства нуклеотидных последовательностей (контигов) анализируемого штамма с геномом бактерии-термофила G. kaustophilus Y412MC52. Охарактеризован протеом выделенной бактерии. Обнаружены ферменты, относящиеся к гемицеллюлазам (эндоксиланаза, бета-ксилозидаза, арабинофуранозидаза), и фермент эндоксиланаза.
Об авторах
А. С. РозановРоссия
Т. В. Иванисенко
Россия
А. В. Брянская
Россия
С. В. Шеховцов
Россия
М. Д. Логачева
Россия
О. В. Сайк
Россия
Т. К. Малуп
Россия
П. С. Деменков
Россия
Т. Н. Горячковская
Россия
В. А. Иванисенко
Россия
С. Е. Пельтек
Россия
Список литературы
1. Бонч-Осмоловская Е.А., Мирошниченко М.Л., Соколова Т.Г., Слободкин А.И. Термофильные микробные сообщества: новые физиологические группы, новые местообитания // Тр. Ин-та микробиологии им. С.Н. Виноградского. М.: Наука, 2004. Вып. 12.
2. Нетрусова А.И. Практикум по микробиологии. М.: Академия, 2005. 608 с.
3. Brock T.D. Thermophilic microorganisms and life at high temperatures. N.Y.: Springer-Verlag, 1978. 465 p.
4. Cripps R.E., Eley K., Leak D.J. et al. Metabolic engineering of Geobacillus thermoglucosidasius for high yield ethanol production // Metab. Eng. 2009. V. 11. P. 398–408.
5. Kanehisa M., Goto S. KEGG: kyoto encyclopedia of genes and genomes // Nucl. Acids Res. 2000. V. 28. P. 27–30.
6. Kanehisa M., Goto S., Sato Y. et al. KEGG for integration and interpretation of large-scale molecular datasets // Nucl. Acids Res. 2012. V. 40. P. D109–D114.
7. Suzuki H., Yoshida K. Genetic transformation of Geobacillus kaustophilus HTA426 by conjugative transfer of host-mimicking plasmids // J. Microbiol. Biotechnol. 2012. V. 22. P. 1279–1287.
8. Tanimura A., Nakamura T., Watanabe I. et al. Isolation of a novel strain of Candida shehatae for ethanol production at elevated temperature // Springerplus. 2012. V. 4. P. 1–27.
9. Taylor M.P., Esteban C.D., Leak D.J. Development of a versatile shuttle vector for gene expression in Geobacillus ssp. // Plasmid 60. 2008. P. 45–52.
10. Zhu X., Cui J., Feng Y. et al. Metabolic adaption of ethanoltolerant Clostridium thermocellum // PLoS ONE. 2013. V. 8. P. E70631.
Дополнительные файлы
Обратные ссылки
- Обратные ссылки не определены.
