Preview

Вавиловский журнал генетики и селекции

Расширенный поиск

БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА ШТАММА Geobacillus stearothermophilus 22, ВЫДЕЛЕННОГО ИЗ ГОРЯЧЕГО ИСТОЧНИКА ГАРГА (ПРИБАЙКАЛЬЕ)

Полный текст:

Аннотация

Новый штамм Geobacillus stearothermophilus 22 был выделен из термального источника Гарга, расположенного в Баргузинской долине Прибайкалья. Были проанализированы морфологические и биохимические особенности G. stearothermophilus 22, проведено полногеномное секвенирование с последующим биоинформатическим анализом. Показана высокая степень сходства нуклеотидных последовательностей (контигов) анализируемого штамма с геномом бактерии-термофила G. kaustophilus  Y412MC52. Охарактеризован протеом выделенной бактерии. Обнаружены ферменты,  относящиеся к гемицеллюлазам (эндоксиланаза, бета-ксилозидаза, арабинофуранозидаза), и фермент эндоксиланаза.

Об авторах

А. С. Розанов
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


Т. В. Иванисенко
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


А. В. Брянская
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


С. В. Шеховцов
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


М. Д. Логачева
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова»
Россия


О. В. Сайк
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


Т. К. Малуп
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


П. С. Деменков
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


Т. Н. Горячковская
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


В. А. Иванисенко
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


С. Е. Пельтек
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия
Россия


Список литературы

1. Бонч-Осмоловская Е.А., Мирошниченко М.Л., Соколова Т.Г., Слободкин А.И. Термофильные микробные сообщества: новые физиологические группы, новые местообитания // Тр. Ин-та микробиологии им. С.Н. Виноградского. М.: Наука, 2004. Вып. 12.

2. Нетрусова А.И. Практикум по микробиологии. М.: Академия, 2005. 608 с.

3. Brock T.D. Thermophilic microorganisms and life at high temperatures. N.Y.: Springer-Verlag, 1978. 465 p.

4. Cripps R.E., Eley K., Leak D.J. et al. Metabolic engineering of Geobacillus thermoglucosidasius for high yield ethanol production // Metab. Eng. 2009. V. 11. P. 398–408.

5. Kanehisa M., Goto S. KEGG: kyoto encyclopedia of genes and genomes // Nucl. Acids Res. 2000. V. 28. P. 27–30.

6. Kanehisa M., Goto S., Sato Y. et al. KEGG for integration and interpretation of large-scale molecular datasets // Nucl. Acids Res. 2012. V. 40. P. D109–D114.

7. Suzuki H., Yoshida K. Genetic transformation of Geobacillus kaustophilus HTA426 by conjugative transfer of host-mimicking plasmids // J. Microbiol. Biotechnol. 2012. V. 22. P. 1279–1287.

8. Tanimura A., Nakamura T., Watanabe I. et al. Isolation of a novel strain of Candida shehatae for ethanol production at elevated temperature // Springerplus. 2012. V. 4. P. 1–27.

9. Taylor M.P., Esteban C.D., Leak D.J. Development of a versatile shuttle vector for gene expression in Geobacillus ssp. // Plasmid 60. 2008. P. 45–52.

10. Zhu X., Cui J., Feng Y. et al. Metabolic adaption of ethanoltolerant Clostridium thermocellum // PLoS ONE. 2013. V. 8. P. E70631.


Просмотров: 128


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-0462 (Print)
ISSN 2500-3259 (Online)