Preview

Вавиловский журнал генетики и селекции

Расширенный поиск

Идентификация белков, участвующих в привлечении белка Ttk69 к геномным сайтам у Drosophila melanogaster

https://doi.org/10.18699/VJ19.479

Полный текст:

Аннотация

Белки, имеющие в своем соcтаве BTB-домены, играют важную роль в процессах активации и репрессии транскрипции. Белки, содержащие BTB-домены, широко распространены только среди высших эукариот. Многие из таких белков являются транскрипционными факторами, принимающими участие в процессах развития организма. Один из ключевых регуляторов процессов раннего развития – BTB-содержащий белок Ttk (tramtrack), способный взаимодействовать с комплексом ремоделирования нуклеосом и деацетилирования гистонов (dNuRD) дрозофилы. Белок Ttk69 способен напрямую взаимодействовать с двумя белками комплекса dNuRD complex, dMi-2 и MEP1. Можно предположить, что Ttk69 репрессирует мишеневые гены путем ремоделирования хроматина через привлечение комплекса dNuRD. Однако до сих пор неизвестно, что обеспечивает специфичность рекрутирования Ttk на хроматин в процессе негативной/позитивной регуляции генной экспрессии. Несмотря на то что Ttk69 обладает ДНК-связывающей активностью, протяженных специфичных мотивов связывания для него найдено не было. Целью данного исследования был поиск белков, которые могут участвовать в привлечении Ttk к геномным регуляторным элементам. Для поиска белков-партнеров Ttk был проведен скрининг в дрожжевой двугибридной системе против коллекции белков с кластерами доменов «цинковые пальцы» C2H2-типа, способных эффективно и специфично связываться с сайтами в хроматине. В результате два белка, CG10321 и CG1792, были описаны в качестве потенциальных ДНК-связывающих партнеров Ttk. Мы предполагаем, что CG10321 и CG1792 обеспечивают специфичность посадки Ttk на сайты и, как следствие, привлечение NuRD-комплекса к геномным регуляторным элементам. Мы обнаружили также, что белок Ttk может одновременно взаимодействовать с MEP1 и ZnF-белками.

Об авторах

И. С. Осадчий
Институт биологии гена Российской академии наук.
Россия
Москва.


Т. Н. Федорова
Институт биологии гена Российской академии наук.
Россия
Москва.


П. Г. Георгиев
Институт биологии гена Российской академии наук.
Россия
Москва.


О. Г. Максименко
Институт биологии гена Российской академии наук.
Россия
Москва.


Список литературы

1. Boyle M.J., Berg C.A. Control in time and space: Tramtrack69 coope-rates with Notch and Ecdysone to repress ectopic fate and shape changes during Drosophila egg chamber maturation. Development. 2009;136(24):4187-4197. DOI 10.1242/dev.042770.

2. Chen Y.-J., Chiang C.-S., Weng L.-C., Lengyel J.A., Liaw G.-J. Tram- track69 is required for the early repression of tailless expression. Mech. Dev. 2002;116:75-83.

3. Chopra V.S., Srinivasan A., Kumar R.P., Mishra K., Basquin D., Doc- quier M., Seum C., Pauli D., Mishra R.K. Transcriptional activation by GAGA factor is through its direct interaction with dmTAF3. Dev. Biol. 2008;317(2):660-670.

4. Defossez P.A., Kelly K.F., Filion G.J., Perez-Torrado R., Magdinier F., Menoni H., Nordgaard C.L., Daniel J.M., Gilson E. The human en¬hancer blocker CTC-binding factor interacts with the transcription factor Kaiso. J. Biol. Chem. 2005;280(52):43017-43023.

5. Kulakovskiy I.V., Makeev VJ. Discovery of DNA motifs recognized by transcription factors through integration of different experimental sources. Biophysics. 2009;54:667-674.

6. Lai Z.C., Li Y. Tramtrack69 is positively and autonomously required for Drosophila photoreceptor development. Genetics. 1999;152(1): 299-305.

7. Liaw G.J. Pits, a protein interacting with Ttk69 and Sin3A, has links to histone deacetylation. Sci. Rep. 2016;6:33388. DOI 10.1038/ srep33388.

8. Melnick A., Carlile G., Ahmad K.F., Kiang C.L., Corcoran C., Bard- well V, Prive G.G., Licht J.D. Critical residues within the BTB domain of PLZF and Bcl-6 modulate interaction with corepressors. Mol. Cell. Biol. 2002;22(6):1804-1818.

9. Murawsky C.M., Brehm A., Badenhorst P., Lowe N., Becker P.B., Travers A.A. Tramtrack69 interacts with the dMi-2 subunit of the Drosophila NuRD chromatin remodelling complex. EMBO Rep. 2001;2(12):1089-1094.

10. Pagans S., Pineyro D., Kosoy A., Bernues J., Azorin F. Repression by TTK69 of GAGA-mediated activation occurs in the absence of TTK69 binding to DNA and solely requires the contribution of the POZ/BTB domain of TTK69. J. Biol. Chem. 2004;279(11): 9725-9732.

11. Perez-Torrado R., Yamada D., Defossez P.A. Born to bind: the BTB protein-protein interaction domain. BioEssays. 2006;28(12):1194- 1202.

12. Peters N.C., Thayer N.H., Kerr S.A., Tompa M., Berg C.A. Follow¬ing the ‘tracks’: Tramtrack69 regulates epithelial tube expansion in the Drosophila ovary through Paxillin, Dynamin, and the homeo- box protein Mirror. Dev. Biol. 2013;378(2):154-169. DOI 10.1016/j. ydbio.2013.03.017.

13. Pointud J.C., Larsson J., Dastugue B., Couderc J.L. The BTB/POZ do-main of the regulatory proteins Bric a brac 1 (BAB1) and Bric a brac 2 (BAB2) interacts with the novel Drosophila TAF(II) factor BIP2/dTAF(II)155. Dev. Biol. 2001;237(2):368-380.

14. Reddy B.A., Bajpe P.K., Bassett A., Moshkin Y.M., Kozhevnikova E., Bezstarosti K., Demmers J.A., Travers A.A., Verrijzer C.P. Drosoph¬ila transcription factor Tramtrack69 binds MEP1 to recruit the chro¬matin remodeler NuRD. Mol. Cell. Biol. 2010;30(21):5234-5244. DOI 10.1128/MCB.00266-10.

15. Stogios P.J., Downs G.S., Jauhal J.J., Nandra S.K., Prive G.G. Se-quence and structural analysis of BTB domain proteins. Genome Biol. 2005;6(10):R82.

16. Wang C., Guo X., Dou K., Chen H., Xi R. Ttk69 acts as a master re-pressor of enteroendocrine cell specification in Drosophila intestinal stem cell lineages. Development. 2015;142(19):3321-3331. DOI 10.1242/dev.123208.

17. Wen Y., Nguyen D., Li Y., Lai Z.C. The N-terminal BTB/POZ domain and C-terminal sequences are essential for Tramtrack69 to specify cell fate in the developing Drosophila eye. Genetics. 2000;156(1): 195-203.


Просмотров: 199


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-0462 (Print)
ISSN 2500-3259 (Online)