СЕГРЕГАЦИОННЫЕ МОДЕЛИ СЛОЖНЫХ КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ПРИЗНАКОВ И АНАЛИЗ СЦЕПЛЕНИЯ В РАСШИРЕННЫХ ДИАЛЛЕЛЬНЫХ СКРЕЩИВАНИЯХ ПАНЕЛИ РЕКОМБИНАНТНЫХ ИНБРЕДНЫХ ЛИНИЙ
Аннотация
Представлены классы сегрегационных моделей, описывающих характер наследования количественного признака, для расширенных нереципрокных диаллельных скрещиваний рекомбинантных инбредных линий. Отличительной особенностью данной работы являются использование многолокусного подхода и учет эпистатических взаимодействий групп локусов между собой. В построенных классах моделей производится поиск решений, которые с точностью до средовых шумов описывают экспериментальные данные. Далее выполняется анализ сцепления, т. е. определение положения модельных локусов найденных решений на генетической карте хромосом. Апробация процедуры поиска в пространстве моделей и подхода к анализу сцепления проводилась на реальных данных, где в качестве количественного признака выступала масса мозжечка лабораторных мышей. Дано краткое описание реализованного программного обеспечения.
Об авторах
М. С. ДьяковРоссия
А. В. Осадчук
Россия
Список литературы
1. Кобзарь А.И. Прикладная математическая статистика. М.: ФИЗМАТЛИТ, 2006. 816 c.
2. Мазер К., Джинкс Дж. Биометрическая генетика. М.: Мир, 1985. 464 c.
3. Haldane J.B.S., Waddington C.H. Inbreeding and linkage // Genetics. 1931. V. 16. Nо. 4. P. 357–374.
4. Kosambi D.D. The estimation of map distance from recombination values // Annual. Eugenics. 1943. V. 12. Nо. 1. P. 172–175.
5. Neumann P.E. Three-locus linkage analysis using recombinant inbred strains and bayes’ theorem // Genetics. 1991. V. 128. Nо. 3. P. 631–638.
6. Van der Veen J.H. Test of non-allelic interaction and linkage for quantitative characters in generations derived from two diploid pure lines // Genetics. 1959. V. 30. Nо. 3. P. 201–232.