ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ФРАГМЕНТА ГЕНА КИСЛОЙ ВАКУОЛЯРНОЙ ИНВЕРТАЗЫ PAIN-1 У СОРТОВ КАРТОФЕЛЯ
Аннотация
Фермент кислая вакуолярная инвертаза Pain-1 определяет содержание крахмала и сахаров в клетках, а также участвует в формировании ответной реакции растения на воздействие абиотического стресса. Впервые охарактеризована вариабельность фрагмента (экзон V–экзон VII) гена Pain-1 у 19 сортов картофеля российской и зарубежной селекции. Выявлено 25 полиморфных нуклеотидных позиций. Детектирован ранее не описанный SNP С1895 в экзоне VII. 5 из 8 SNPs, детектированных в экзонах, приводили к аминокислотным заменам, три из которых были радикальными. Также были выявлены три аминокислотные замены в последовательности консервативного C-терминального гликозилгидролазного домена.
Ключевые слова
сорта картофеля,
кислая вакуолярная инвертаза,
аллельная вариабельность,
нуклеотидный и аминокислотный полиморфизм
При поддержке: Министерство образования и науки, Президиум РАН
Об авторах
М. А. Слугина
Центр «Биоинженерия» Российской академии наук, Москва, Россия
Биологический факультет Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, кафедра биотехнологии, Москва, Россия
Россия
Россия
Е. З. Кочиева
Центр «Биоинженерия» Российской академии наук, Москва, Россия
Биологический факультет Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, кафедра биотехнологии, Москва, Россия
Россия
Россия
Список литературы
1. Симаков Е.А., Анисимов Б.В., Еланский С.Н., Зейрук В.Н., Кузнецова М.А., Мальцев С.В., Пшеченков К.А., Склярова Н.П., Спиглазова С.Ю., Яшина И.М. Сорта картофеля, возделываемые в России. M.: Агроспас, 2010. 128 c.
2. Слугина М.А., Снигирь Е.А., Рыжова Н.Н., Кочиева Е.З. Структура и полиморфизм фрагмента локуса Pain-1, кодирующего вакуолярную инвертазу Solanum // Молекуляр. биология. 2013. T. 47. C. 243–250.
3. Albacete A., Grosskinsky D.K., Roitsch T. Trick and treat: A review on the function and regulation of plant invertases in the abiotic stress response // Phyton – Annales Rei Botanicae. 2011. V. 50. P. 181–204.
4. Castrillόn-Arbeláez P.A., Martínez-Gallardo N., Arnaut H.A., Tiessen A., Délano-Frier J.P. Metabolic and enzymatic chan-ges associated with carbon mobilization, utilization and replenishment triggered in grain amaranth (Amaranthus cruentus) in response to partial defoliation by mechanical injury or insect herbivory // Plant Biol. 2012. V. 12. P. 163–185.
5. Draffehn A.M., Sebastian M., Li L., Gebhardt C. Natural diversity of potato (Solanum tuberosum ) invertases // BMC Plant Biol. 2010. V. 10. P. 271–286.
6. Elliott K.J., Butler W.O., Dickinson C.D., Konno Y. et al. Isolation and characterization of fruit vacuolar invertase genes from two tomato species and temporal differences in mRNA levels during fruit ripening // Plant Mol. Biol. 1993. V. 21. P. 515–524.
7. Ji X., Ende van den W., Laere van A. et al. Structure, evolution and expression of the two invertase gene families of rice // Mol. Evol. 2005. V. 60. P. 615–634.
8. Koch K. Sucrose metabolism: regulatory mechanisms and pivotal roles in sugar sensing and plant development // Curr. Opin. Plant Biol. 2004. V. 7. P. 235–246.
9. Kumar S., Tamura K., Peterson D. et al. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. No. 10. P. 2731–2739.
10. Li L., Paulo M-J., Strahwald J., Lubeck J., Natural H-R. DNA variation at candidate loci is associated with potato chip color, tuber starch content, yield and starch yield // Theor. Appl. Genet. 2008. V. 116. P. 1167–1181.
11. Ruan Y-L., Jin Y., Yang Y-J., Li G-J., Boyer J.S. Sugar input, metabolism, and signaling mediated by invertase: roles in development, yield potential, and response to drought and heat // Mol. Plant. 2010. V. 3. P. 942–955.
Рецензия
Просмотров:
603
Послать статью по эл. почте 