Preview

Вавиловский журнал генетики и селекции

Расширенный поиск

КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ САЙТОВ СВЯЗЫВАНИЯ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ AP2/ERF В ГЕНОМЕ ARABIDOPSIS THALIANA L.

Аннотация

У растений этилен участвует как в регуляции процессов развития, так и в ответе на стрессовые воздействия. Сигнал с рецепторов этилена активирует гены одного из самых больших семейств транскрипционных факторов, APETALA2/ETHYLENE RESPONSE FACTORs (ERFs). Сайты связывания ERF транскрипционных факторов содержат специфический GCCGCC-мотив и называются GCC-боксами. В настоящей работе две компьютерные программы для предсказания сайтов связывания транскрипционных факторов (oPWM и SiteGA) применены для анализа последовательностей экспериментально подтвержденных GCC-боксов. Распознаны GCC-боксы и исследовано их распределение в геноме Arabidopsis thaliana L. Проведены функциональная аннотация распознанных GCC-боксов и анализ их роли в ответе на фитогормон этилен.

Просмотров: 502


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-3259 (Online)