MODELING OF PLANT TISSUE GROWTH AND DEVELOPMENT WITH L-SYSTEMS
Abstract
An introduction to modeling of dynamical systems possessing dynamical structures with L-systems is given. Application of L systems is illustrated by models of plant tissue growth and control of state variable distribution in the growing tissue.
About the Authors
U. S. Zubairova
Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia
Russian Federation
Russian Federation
A. V. Penenko
Institute of Computational Mathematics and Mathematical Geophysics, Novosibirsk, Russia
Russian Federation
Russian Federation
S. V. Nikolaev
Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И. и др. Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани // Вычисл. технол. 2006. Т. 11. Вып. 2. С. 67–81.
2. Рис. 6. Вероятность (P) разрушения структуры АМП на протяжении времени, равного 20 клеточным циклам, в зависимости от отношения длины клеточного цикла к безразмерному характерному
3. времени диффузии (τ).
4. Николаев С.В., Пененко А.В., Лавреха В.В. и др. Модельное изучение роли белков СLV1, CLV2, CLV3 и WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега // Онтогенез. 2007. Т. 38. Вып. 6. С. 457–462.
5. Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И. и др. Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учетом деления клеток // СибЖИМ. 2010. Т. 13. Вып. 4(44). С. 70–82.
6. Honda H., Tanemura M., Nagai T. A three-dimensional vertex dynamics of model of space-fi lling polyhedra simulating cell behavior in a cell aggregate // J. Theor. Biol. 2004. V. 226. P. 439–453.
7. Lindenmayer A. Mathematical models for cellular interaction in development, Parts I and II // J. Theor. Biol. 1968. V. 18. P. 280–315.
8. Merks R., Guravage M., Inze D., Beemster G. VirtualLeaf: an open-source framework for cell-based modeling of plant tissue growth and development // Plant Physiol. 2011. V. 155(2). P. 656–666.
9. Prusinkiewicz P., Lindenmayer A. The Algorithmic Beauty of Plants. Springer-Verlag, N.Y., 1990.
10. Prusinkiewicz P., Hammel M., Mjolsness E. Animation of plant development // Computer Graphics Proceedings, Annual Conference Series. Proc. of SIGGRAPH 93, Anaheim, California (1–6 August, 1993). 1993. P. 351–360.
11. Tuza Z., Lindenmayer A. Locally Generated Colourings of Hexagonal Cell Division Patterns: Application to Retinal Cell Differentiation // Lindenmayer Systems: Impacts on Theoretical Computer Science, Computer Graphics, and Developmental Biology / Eds G. Rozenberg, A. Salomaa. Berlin: Springer-Verlag, 1992. P. 333–350.
Review
Views:
437
Email this article 