Особенности генофондов лесных и тундровых ненцев по гаплогруппам Y-хромосомы

   Исследованы лесные и тундровые ненцы из различных районов Ямало-Ненецкого автономного округа по маркерам Y-хромосомы. Представлены результаты генетической структуры ненецких родов по 44 STR-маркерам Y-хромосомы с учетом их принадлежности к субэтносам (тундровые и лесные ненцы), а также к фратриям Харючи («настоящие ненцы») и Вануйто («иноплеменники»). Количество ненцев N = 606 делится на тундровых (N = 536) и лесных (N = 70). Для родов, принадлежащих к фратрии Харючи, специфична сублиния N1a2b1b1a~-B170, а для родов фратрии Вануйто – N1a2b1b1b-B172. У большинства родов, относящихся к субэтносу лесных ненцев, присутствует гаплогруппа N1a2b1-B478. Все мужчины рода Пяк, доминирующего у лесных ненцев, принадлежат к специфичной гаплогруппе N1a1a1a1a2a1c1~. Результаты работы свидетельствуют о том, что родовые объединения ненцев, как правило, имеют общего предка по мужской линии, для них характерен недавний эффект основателя. Каждый ненецкий род имеет свой специфичный кластер гаплотипов, равноудаленных друг от друга. Структура гаплотипов и гаплогрупп Y-хромосомы в составе ненецкого генофонда демонстрирует наследие ненцев от хантов и энцев. Для многих образцов из этих выборок показаны индивидуальные редкие гаплотипы, которые отсутствуют в базах данных и значительно отличаются от других гаплотипов, обнаруженных в этих популяциях. Они относятся к различным редким ветвям гаплогрупп Y-хромосомы, обнаруженным только в этих выборках. Часть образцов формирует отдельные варианты гаплотипов, которые не были описаны ранее, и позволяет более подробно охарактеризовать филогению этих линий. Лесные и тундровые ненцы сильно различаются по составу гаплогрупп, что полностью соответствует данным этнологов и лингвистов о происхождении этих популяций. У лесных ненцев преобладают гаплогруппа N1a1a1a1a2a1c1~-Y13850, Y13852, Y28540 CTS9108 (xY24219,Y24375) и с небольшой частотой гаплогруппа N1a2b1-B478, Z35080, Z35081, Z35082, Z35083, Z35084 (xB169). У тундровых ненцев доминируют три гаплогруппы, N1a2b1b1a~-B170 (xZ35104), N1a1a1a1a2a1c~-Y13850, Y13852, Y13138, PH3340 (xY24219,Y24365) и N1a2b1b1b-B172, Z35108.

1. Adamov D.S., Fedorova S.A. Y-chromosomal STRs mutation rates in the Yakut population. Russ J Genet. 2024;60(4):533-542. doi: 10.1134/S1022795424040021

2. Adamov D.S., Alekseev A.N., Fedorova S.A. Dating the time to the most recent common ancestor of the Sakha (Yakuts) with Y chromosomal haplogroup N3A2-M1982: new ethnogenetic reconstructions. Yakutskiy Meditcinskiy Zhurnal = Yakut Med J. 2024;2:88-93. doi: 10.25789/YMJ.2024.86.21 (in Russian)

3. Adamov D., Guryanov V., Karzhavin S., Tagankin V., Urasin V. Defining a new rate constant for Y-chromosome SNPs based on full sequencing data. Russ J Genet Geneal. 2015;7(1):68-89

4. Alekseeva T.I., Volkov-Dubrovin V.P., Golubchikova Z.A., Pavlovsky O.M., Smirnova N.S., Spitsyn V.A. Anthropological study of the Forest Nenets (morphology, physiology and population genetics). Part II. Voprosy Antropologii = Herald of Anthropology. 1972;42: 31-54 (in Russian)

5. Balanovsky O. Toward a consensus on SNP and STR mutation rates on the human Y-chromosome. Hum Genet. 2017;136(5):575-590. doi: 10.1007/s00439-017-1805-8

6. Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol. 1999;16(1):37-48. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036

7. Derenko M., Malyarchuk B., Denisova G., Wozniak M., Grzybowski T., Dambueva I., Zakharov I. Y-chromosome haplogroup N dispersals from south Siberia to Europe. J Hum Genet. 2007;52(9): 763-770. doi: 10.1007/s10038-007-0179-5

8. Dolgikh B.O. The Tomsk Uezd. In: Dolgikh B.O. The Clanish and Tribal Composition of the Population of Siberia in the 17^th Century. Moscow: USSR Academy of Sciences Publ, 1960;94-104 (in Russian)

9. Ilumäe A.-M., Reidla M., Chukhryaeva M., Järve M., Post H., Karmin M., Saag L., … Balanovsky O., Kivisild T., Underhill P.A., Villems R., Rootsi S. Human Y chromosome haplogroup N: a non-trivial time-resolved phylogeography that cuts across language families. Am J Hum Genet. 2016;99(1):163-173. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.05.025

10. Karafet T.M., Osipova L.P., Gubina M.A., Posukh O.L., Stephen L., Zegura S.L., Hammer M.F. High levels of Y-chromosome differentiation among native Siberian populations and the genetic signature of a boreal hunter-gatherer way of life. Hum Biol. 2002;74(6):761-789. doi: 10.1353/hub.2003.0006

11. Kharkov V.N., Valikhova L.V., Yakovleva E.L., Serebrova V.N., Kolesnikov N.A., Petelina T.I., Khitrinskaya I.Yu., Stepanov V.A. Reconstruction of the origin of the Gydan Nenets based on gene tic analysis of their tribal structure using a new set of YSTR mar kers. Russ J Genet. 2021;57(12):1414-1423. doi: 10.1134/S1022795421120061

12. Kharkov V.N., Kolesnikov N.A., Valikhova L.V., Zarubin A.A., Svarovskaya M.G., Marusin A.V., Khitrinskaya I.Yu., Stepanov V.A. Relationship of the gene pool of the Khants with the peoples of Western Siberia, Cis-Urals and the Altai-Sayan Region according to the data on the polymorphism of autosomic locus and the Y-chromosome. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov J Genet Breed. 2023;27(1):46-54. doi: 10.18699/VJGB-23-07

13. Khomich L.V. Nenets legends about Sihirtya. In: Folklore and Ethnography. Leningrad, 1970;59-69 (in Russian)

14. Khomich L.V. Issues of the Ethnogenesis and Ethnic History of the Nenets. Leningrad: Nauka Publ., 1976 (in Russian]

15. Kvashnin Yu.N. Basic elements of the clan structure of the Gydan Nenets. Vestnik Arkheologii, Antropologii i Etnografii = Herald of Archeology, Anthropology, and Ethnology. 2001;3:199-204 (in Russian)

16. Kvashnin Yu.N. Tribal names in Nenets toponomy. Anthropologi­cheskij Forum = Forum for Anthropology and Culture. 2011;S14: 23-66 (in Russian)

17. Maitinskaya K.E. Finno-Ugric languages. Introduction. In: Languages of the Peoples of the USSR. Vol. 3. Moscow: Nauka Publ., 1966;9-25 (in Russian)

18. Mirabal S., Regueiro M., Cadenas A.M., Cavalli-Sforza L.L., Underhill P.A., Verbenko D.A., Limborska S.A., Herrera R.J. Y-chromosome distribution within geo-linguistic landscape of northwestern Russia. Eur J Hum Genet. 2009;17:1260-1273. doi: 10.1038/ejhg.2009.6

19. Peoples of West Siberia: Khanty, Mansi, Selkups, Nenets, Enets, Nganasans, Kets. Moscow: Nauka Publ., 2005 (in Russian)

20. Poznik D., Henn B., Yee M.-C., Sliwerska E., Euskirchen G., Lin A., Snyder M., Quintana-Murci L., Kidd J.M., Underhill P.A., Bustamante C.D. Sequencing Y chromosomes resolves discrepancy in time to common ancestor of males versus females. Science. 2013; 341(6145):562-565. doi: 10.1126/science.1237619

21. Prokofiev G.N. Ethnogenesis of the peoples of the Ob-Yenisei region (Nenets, Nganasans, Enets, Selkups, Kets, Khanty, and Mansi). Sovetskaya Etnografiya = Soviet Ethnology. 1940;3:67-76 (in Russian)

22. Rootsi S., Zhivotovsky L.A., Baldovic M., Kayser M., Kutuev I.A., Khusainova R., Bermisheva M.A., … Ferak V., Parik J., Kivisild T., Underhill P.A., Villems R. A counter-clockwise northern route of the Y-chromosome haplogroup N from Southeast Asia towards Europe. Eur J Hum Genet. 2007;15(2):204-211. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201748

23. Tambets K., Rootsi S., Kivisild T., Help H., Serk P., Loogväli E.-L., Tolk H.-V., … Ferák V., Füredi S., Komel R., Beckman L., Villems R. The western and eastern roots of the Saami – the story of genetic “outliers” told by mitochondrial DNA and Y chromosomes. Am J Hum Genet. 2004;74(4):661-682. doi: 10.1086/383203

24. Tereshchenko N.M. Materials and Research on the Nenets Language. Moscow, 1956 (in Russian)

25. UNESCO. Atlas of the World’s Languages in Danger. 2010. Available: https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000187026

26. Underhill P.A., Shen P., Lin A.A., Passarino G., Yang W.H., Kauffman E., Bonné-Tamir B., … Piazza A., Davis R.W., Feldman M.W., Cavalli-Sforza L.L., Oefneret P.J. Y chromosome sequence variation and the history of human populations. Nat Genet. 2000;26(3):358-361. doi: 10.1038/81685

27. Vasiliev V.I. On the genetic nature of the ethnic components of the Forest Nenets. Sovetskaya Etnografiya = Soviet Ethnology. 1973;4: 106-112 (in Russian)

28. Vasiliev V.I. The formation of the Yenisei Nenets: on the ethnic nature of ethnographic groups in modern peoples of the North). In: Ethnogenesis and Ethnic History of the Peoples of the North. Moscow: Nauka Publ., 1975;111-147 (in Russian)

29. Verbov G.D. Forest Nenets. Sovetskaya Etnografiya = Soviet Ethnol­ogy. 1939;2:43-65 (in Russian)

30. Volzhanina E.A. Sociodemographic aspects of the Yamal Nenets people according to all-Russia censuses of the 21^st century. Vestnik Arkheologii, Antropologii i Etnografii = Herald of Archeology, Anthropology, and Ethnology. 2017;3(38):120-130. doi: 10.20874/2071-0437-2017-38-3-120-130 (in Russian)

31. Zhivotovsky L.A., Underhill P.A., Cinnioglu C., Kayser M., Morar B., Kivisild T., Scozzari R., … Yong K.K., Gresham D., Tournev I., Feldman M.W., Kalaydjieva L. On the effective mutation rate at Y- chromosome STRs with application to human population divergence time. Am J Hum Genet. 2004;74(1):50-61. doi: 10.1086/380911