Preview

Вавиловский журнал генетики и селекции

Расширенный поиск
Том 22, № 3 (2018)
Скачать выпуск PDF
 
295 20
Аннотация

Автор: Академик В.К. Шумный

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ РЕСУРСЫ РАСТЕНИЙ

296-303 169
Аннотация

Рис посевной (Oryza sativa L.) обеспечивает питание более половины населения Земли. Традиционно он считается азиатской культурой, но возделывается также в Африке, Америке, Австралии и Южной Европе. Основные площади посева риса в странах мира занимают белозерные сорта. Дикорастущие предки культурного риса имели окрашенный перикарп зерна. В странах традиционного рисоводства наряду с белозерными сортами выращивают краснозерный и чернозерный рис для использования в качестве диетического и лечебного продукта. Его употребляют в пищу без предварительного шлифования крупы, поэтому сохраняются все питательные и биологически активные вещества, которыми ценится эта культура. Рис с окрашенным перикарпом зерна обладает более высокой антиоксидантной активностью, чем белозерный. В обзоре представлены данные о содержании в сортах краснозерного и чернозерного риса антиоксидантных соединений: фенольных кислот, флавоноидов, γ-оризанола, антоцианов, проантоцианидинов и др. С учетом полезных свойств растений риса с окрашенным перикарпом зерна в ведущих рисосеющих странах Азии проводится селекционная работа по созданию современных пигментированных сортов. В европейских странах – Италии и Франции – на основе азиатских сортов созданы также краснозерные и чернозерные сорта риса с высоким содержанием фитохимических эле ментов. С 2001 г. селекция сортов риса с окрашенным перикарпом зерна начата в Российской Федерации. Созданы сорта риса: краснозерные – Марс и Рубин (2012 г.) и чернозерный глютинозный – Южная ночь (2014 г.), которые включены в Государственный реестр охраняемых селекционных достижений. У этих сортов выявлено большое количество олеиновой и линоленовой кислот (до 43 % каждой), тогда как у белозерного сорта риса Рапан обнаружены только их следы. Установлены значительные отличия по содержанию антиоксидантов: Рапан – 7, Марс и Рубин – по 45, Южная ночь – 105 мг/100 г продукта. Эти сорта внедрены в производство и используются для диетического питания и в качестве исходного материала для создания новых эксклюзивных сортов риса.

304-309 138
Аннотация

Яровой тритикале (x Triticosecale Wittmack) для Западно-Сибирского региона является относительно новой и малоизученной культурой. Цель данного исследования – опреде ление возможностей адаптации сортов и гибридов ярового тритикале к различным условиям произрастания в Западной Сибири. Эксперимент проводился в 2014 г. на опыт ном поле Сибирского федерального научного центра агробиотехнологий РАН. Изучались семь форм ярового тритикале: три мутантные формы факультативного типа развития (Сирс 57/2/4, Цекад 90/5, О.312/38), три гибрида F5 (Сирс 57/2/4 x Укро, Укро x K-3881, сложный гибрид озимая пшеница Филатовка x озимая рожь Короткостебельная 69 x Сирс 57/2/4) и сорт Укро – образец из коллекции ВИР с каталожным номером К-3644. Опыт был проведен при двух нормах высева (400 зерен на 1 м2 и 800 зерен на 1 м2) и двух сроках посева (15.05.2014 и 27.05.2014) в четырех повторностях. Образцы оценивались по девяти признакам, связанным с урожайностью и качеством зерна (общий вес зерен, число продуктивных побегов, высота растения, длина колоса, число колосков в колосе, число зерен в колосе, вес зерен колоса, масса 1 000 зерен, натура зерна). В результате проведенного трехфакторного дисперсионного анализа установлено, что различия в плотности сева являлись главным источником вариации большинства изучаемых признаков. Только вариации массы 1 000 зерен и натуры зерна были обусловлены преимущественно генотипическими особенностями растений. Наибольшая зерновая продуктивность образцов получена при сроке посева 15.05.2014 и плотности посева 400 зерен на 1 м2. Мутантные формы ярового тритикале в проведенном опыте показали более низкий уровень адаптивности к различным условиям произрастания по сравнению с сортом Укро.

310-315 100
Аннотация

Использование «яровых аналогов» для исследования зимостойкости пшеницы дает возможность создавать более зимостойкие сорта. Пластичность образа жизни (способность развиваться по яровому типу при яровом посеве) озимых сортов позволяет выделять такие «аналоги». В условиях Западной Сибири проверена зимостойкость 34 озимых образцов пшеницы и тритикале из Краснодара. Их потомства были посеяны ранней весной вблизи Новосибирска для изучения их пластичности и получения «яровых аналогов». Осенью у пяти образцов не было фертильных растений, а у остальных 29 образцов их доля не превышала 59.3 % отчасти из-за наличия стерильных растений. Полученное яровое потомство было высеяно на месяц позже в следующем году. Осенью среди потомков лишь 15 озимых образцов обнаружены фертильные растения. Но у 28 образцов присутствовали также растения в стадии кущения к началу зимовки. Некоторые из них перезимовали и сформировали семена на следующий год раньше посевов озимых сортов. Несмотря на песчанистую почву (низкое содержание влаги) и сильную майско-июньскую засуху, среди этих растений наблюдалась измен чивость по продуктивности. Такие «озимояровые» растения можно использовать для селекции образцов пшеницы и тритикале, пригодных для посева в конце весны – начале лета и уборки на следующий год раньше озимых  сортов. Эти образцы будут соответствовать требованиям sustainable agriculture, потому что «озимо-яровые» растения были выде лены в крайне неблагоприятных условиях: песчанистая кислая (pH 4.9–5.3) малоплодородная почва без внесения удобрений, содержание азота в верхнем слое 0–40 см ниже 25 кг/га. Существует теоретическая возможность селекции «озимо-яровых» растений в качестве подпокровной культуры.

316-320 142
Аннотация

Картофель – одна из важнейших пищевых культур в мире, подвержен поражению вирусами, грибами, бактериями, что снижает его урожайность и приносит большой экономический ущерб. Достижения современной биотехнологии позволяют создавать устойчивые сорта растений, для которых традиционные методы селекции затруднены, путем модификации их генома. Необходимы эффективные и воспроизводимые методики регенерации картофеля в культуре in vitro. Три сорта сибирской селекции Тулеевский, Кемеровчанин, Сафо и два контрольных сорта Голубизна и Никулинский использовали в работе в качестве модельных для оценки их морфогенетического потенциала в культуре in vitro. Экспланты стебля получали от растений, выращенных in vitro в пробирках. Стеблевые экспланты исследуемых сортов культивировали на основной среде Мурасиге–Скуга с добавлением 1 мг/л транс­зеатина, 0.1 мг/л индолилуксусной кислоты, 10 мг/л гиббереллина  и витаминов (среда Р1). Все этапы культивирования, вплоть до  получения полноценных растений­регенерантов, проводили на среде Р1. Каждые две недели экспланты переносили на свежие  питательные среды. Все сорта формировали каллус, но различались по срокам каллусообразования и типу формируемого каллуса. При дальнейшем культивировании сортов на среде того же состава наблюдали морфогенез – образование побегов на раневых поверхностях экспланта. Высокую регенерационную способность проявили сорта Тулеевский, Кемеровчанин и Голубизна (73–97.7 %), низкую – сорт Сафо (63 %). Обнаружен внутрисортовой полиморфизм по способности к регенерации у сибирских сортов. Регенеранты укоренялись на среде Мурасиге – Скуга, без добавления  фитогормонов на седьмой день культивирования. В контроле (на среде без добавления фитогормонов) стеблевые экспланты всех пяти сортов не формировали каллус и не развивали побеги на раневых поверхностях. Предлагаемый способ индукции морфо­генеза в культуре in vitro у картофеля прост, эффективен и может быть использован для других сортов.

ГЕНЕТИКА И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ

321-328 130
Аннотация
Одной из актуальных проблем современной генетики и селекции является расширение генетического разнообразия мягкой пшеницы по генам устойчивости к биотическим и абиотическим стрессовым факторам, урожайности и качества зерна. Дикорастущие и культурные родичи c различным уровнем гомеологии геномов постоянно используются для расширения генетического разнообразия мягкой пшеницы по генам, повышающим устойчивость к болезням и вредоносным насекомым. Ведутся работы по поиску и интродукции генетических факторов, влияющих на содержание белка в зерне и компоненты урожайности. Несмотря на то что локусы устойчивости в организме донора оказывают длительную защиту против популяций патогенов, разнообразных по расовому составу, интрогрессия целевых локусов в геном мягкой пшеницы может приводить к значительному снижению эффективности генов, вплоть до полной потери экспрессии. Перенос чужеродных генов от отдаленных видов происходит в составе целых хромосом, хромосомных плеч либо протяженных транслоцированных фрагментов, которые вместе с целевыми локусами могут содержать дополнительный генетический материал, оказывающий влияние на другие хозяйственно ценные признаки. Поэтому при интродукции генов устойчивости к болезням в коммерческие сорта пшеницы важно учитывать эффекты чужеродных замещений и транслокаций на такие признаки, как тип развития, время колошения, продуктивность, качество зерна, хлебопекарные качества. Негативные эффекты, наблюдаемые при интрогрессии генов от видов с отдаленными геномами, принято связывать с чужеродным хроматином, который переносится вместе с целевым локусом. Однако во многих случаях такие эффекты могут быть результатом влияния генотипической среды реципиента. Публикации, в которых приводятся результаты сравнительной оценки сортов и селекционных линий с чужеродными замещениями и транслокациями, не всегда  позволяют однозначно ответить на этот вопрос. В настоящей статье представлен обзор литературных данных по влиянию  чужеродных интрогрессий на хозяйственно важные признаки мягкой пшеницы.
329-332 121
Аннотация

Одно из приоритетных направлений селекции озимой мягкой пшеницы в настоящее время – обеспечение сопротивляемости листовым заболеваниям и, в частности, бурой ржавчине как самой вредоносной из них. Ген устойчивости к бурой ржавчине, Lr34, обеспечивает резистентность растений пшеницы по типу медленного развития. Использование Lr34 в сочетании с другими генами устойчивости к бурой ржавчине (Lr2c, Lr10, Lr12, Lr13, Lr16 и др.) позволит получить образцы и сорта, менее подверженные болезни в полевых условиях. Целью работы была идентификация гена Lr34 в сортах и коллекционных образцах озимой мягкой пшеницы ФГБНУ «Аграрный научный центр «Донской» (АНЦ «Донской»), поскольку предполагалось его присутствие благодаря вовлечению в гибридизацию в 1960­е гг. сорта Безостая 1, а изучение этого гена в нашем коллекционном материале ранее не проводилось. В статье представлены результаты работы по идентификации у 646 образцов озимой мягкой пшеницы (в том числе 36 сортов АНЦ «Донской», внесенных в Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию, и 8 сортов, проходящих государственное сортоиспытание) гена устойчивости к бурой ржавчине Lr34 и его аллельного состояния. Оценка аллелей гена Lr34 проводилась при помощи кодоминантного молекулярного STS­маркера csLV34 методом полимеразной цепной реакции. Всего было идентифицировано 238 образцов, несущих ген устойчивости к бурой ржавчине Lr34 в доминантном аллельном состоянии. Сорта селекции АНЦ «Донской» Находка, Бонус, Конкурент, Аксинья, Казачка, Донская полукарликовая, Донская безостая, Изюминка, Зерноградка 9, Зерноградка 10 и Зерноградка 11 рекомендуются в качестве источников гена Lr34 для селекции на устойчивость озимой мягкой пшеницы к болезням сельскохозяйственных культур, поскольку несут его доминантный аллель.

333-342 157
Аннотация
Помимо зеленой окраски, обусловленной хлорофиллом, у ячменя зерно и вегетативные органы могут быть окрашены соединениями фенольной природы, такими как меланины и флавоноидные пигменты антоцианы и проантоцианидины. В связи с широкой биологической активностью данных соединений и их неокрашенных предшественников в отношении растений и человека в последнее время наблюдается повышенный интерес к изучению генов, определяющих окраску у растений. Наиболее изученной является система генов, участвующих в синтезе флавоноидных пигментов. С семидесятых годов прошлого века в геноме ячменя идентифицированы и локализованы как структурные гены, кодирующие ферменты метаболизма флавоноидов, так и регуляторные гены, определяющие тканеспецифическое накопление данных пигментов в тканях зерна, а также в вегетативных органах. К настоящему времени выделены нуклеотидные последовательности регуляторных генов Ant1 и Ant2, определяющих накопление антоцианов в перикарпе зерна, гена Ant28, контролирующего биосинтез проантоцианидинов (конденсированных таннинов) в семенной оболочке, a также генов HvMpc2, HvMyc2, HvWD40, определяющих накопление антоцианов в алейроновом слое зерновки ячменя. Менее изучена меланиновая окраска. Ввиду сложной структуры и устойчивости к различным растворителям химическая природа данных пигментов до сих пор не установлена. Однако благодаря сравнительному анализу транскриптомов в окрашенных и неокрашенных чешуях колоса и зерна почти изогенных линий ячменя удалось идентифицировать метаболические пути, лежащие в осно- ве формирования меланиновой пигментации. В предложенной статье проводится обзор результатов работ, посвященных исследованиям генетического контроля формирования окраски у ячменя.
343-352 181
Аннотация

Согласно Доктрине продовольственной безопасности Российской Федерации, в ближайшей перспективе предполагается расширение ассортимента продуктов здорового питания. Вследствие этого необходим поиск соответствующих пищевых источников. К веществам, способствующим профилактике ряда серьезных заболеваний человека, относятся антиоксиданты, а одним из важных параметров качества пищевых продуктов и ингредиентов выступает их антиоксидантная активность. В настоящее время суммарное содержание антиоксидантов и их антиоксидантная активность достаточно полно установлены в овощах и фруктах. При этом найдено, что по сравнению с эквивалентным количеством мягких фруктов или широко употребляемых в пищу овощей цельное зерно злаков обеспечивает более высокое количество связанных полифенолов. Последние включаются в обмен веществ в толстой кишке и могут обеспечивать тем самым положительное влияние на здоровье человека. На примере 30 различных коммерческих зерновых завтраков показано, что содержащиеся в средней порции хлопьев, приготовленных на овсяной основе, уровни полифенолов сопоставимы с таковыми, находящимися в эквивалентном количестве овощей и фруктов. Известно, что зерно овса и ячменя имеет высокую питательную ценность, содержит ненасыщенные жирные кислоты, основные минеральные элементы, белки и бетаглюканы (самые высокие уровни среди зерновых злаков), а также характеризуется наличием разнообразных химических веществ с антиоксидантными свойствами. В последние годы в некоторых западных странах начаты работы по изучению содержания антиоксидантов в зерне различных культурных злаков. В России лишь небольшое количество работ посвящено исследованию этих важных химических соединений в зерне овса и ячменя. Следует отметить, что, хотя зерновые культуры считаются одним из основных компонентов питания человека, исследований в области определения их антиоксидантной активности проведено недостаточно. С целью привлечения внимания российских растениеводов, селекционеров, физиологов растений, генетиков и биотехнологов к указанной проблеме читателю предлагается обзор современной литературы.

353-362 135
Аннотация

Для создания стрессоустойчивых, продуктивных и качественных сортов пшеницы нередко используется генетическое разнообразие диких и культурных сородичей –  различных видов, относящихся к родам Triticum и Aegilops. Ранее с участием образцов Triticum militinae, T. timopheevii, T. kiharae, Aegilops cylindrical и Ae. triaristata были созданы и отобраны по устойчивости и урожайности интрогрессивные формы озимой мягкой пшеницы. Целью настоящей работы стала оценка биохимического состава и технологических свойств зерна данных форм. Анализ муки по содержанию клейковины методом ИСО выявил уровень изменчивости от 28.5 % для формы Эритроспермум 350 × T. militinae до 39.6 % для генотипа Жетысу × T. militinae. При этом качество клейковины первой группы (класс «сильная») выявлено только для генотипов Эритроспермум 350 × T. militinae и (Безостая 1 × T. militinae) × T. militinae. По физическим свойствам муки и теста интрогрессивные формы варьируют по разжижению теста от 80 до 170 е. ф., т. е. на  уровне «филлера» и «слабой» пшеницы, с лучшим значением как по разжижению, так и по валориметрической оценке для генотипов Безостая 1 × Ae. triaristata и Эритроспермум 350 × T. militinae (80 ед. разжижения, 49 ед. фаринографа и 80–45 е. ф. соответственно). Хлебопекарная оценка показывает, что из муки зерна интрогрессивных форм выпекается хлеб объемом, сопоставимым с сортами, в том числе выше сортов-стандартов Алмалы (720–760 мл) и Карахан (800 мл) по внешнему виду, пористости хлеба и общей хлебопекарной оценке. По твердозерности дикие сородичи и интрогрессивные формы характеризовались в основном как средне- и твердозерные (52–93 ед. SKCS). Таким образом, по технологической оценке хлебопекарного типа изученные интрогрессивные формы относятся в основном к классам «ценная» и «филлер», по силе муки и объему хлеба – к классу «слабая», при прогнозе по составу ВМС глютенина и наличию транслокации 1В/1R – к классу «сильная».

ПОПУЛЯЦИОННАЯ ГЕНЕТИКА

363-369 137
Аннотация

Листовые болезни яровой пшеницы – бурая ржавчина (возбудитель – Puccinia triticina), желтая пятнистость ( пиренофороз) (Pyrenophora tritici-repentis) и темно-бурая пятнистость (Сochliobolus sativus = Bipolaris sorokiniana) – относятся к группе распро - страненных и потенциально опасных болезней в западноазиатских регионах России и Северном Казахстане. Для обоснования стратегий генетической защиты пшеницы необходимы популяционные исследования фитопатогенов. Цель работы –  характеристика структуры популяций возбудителей бурой ржавчины и желтой пятнистости яровой пшеницы по признакам вирулентности и оценка распространенности возбудителя темно-бурой пятнистости в западноазиатских регионах Российской Федерации и Северном Казахстане в 2017 г. Источником инфекционного материала служили пораженные бурой ржавчиной и пятнистостями листья образцов яровой пшеницы, собранные в Челябинской и Омской областях и Северном Казахстане. Анализ вирулентности 109 изолятов P. triticina на 20 линиях-дифференциаторах показал, что все изученные монопустульные изоляты были авирулентны к ТсLr24. Изоляты, вирулентные к ТсLr19, выявлены только в челябинской популяции. Частоты вирулентных изолятов к ТсLr2a, ТсLr2b, ТсLr2c, ТсLr11, ТсLr15, ТсLr16, ТсLr20 и ТсLr26 были выше в омской и североказахстанской популяциях, а к ТсLr9 – в челябинской. При использовании 20 ТсLr-ли ний определено 27 фенотипов вирулентности P. triticina: 12 в омской, 19 в челябинской,  8 в казахстанской. Фенотипы TLTTR (авирулентность (av) к ТсLr16, ТсLr19, ТсLr24, ТсLr26), TCTTR (av: TcLr9, TcLr16, ТсLr19, ТсLr24), TBTTR (av: ТсLr9, ТсLr16, ТсLr19, ТсLr24, ТсLr26) встречались во всех регионах. Фенотипы TQTTR (av: ТсLr19, ТсLr24, ТсLr26) и TGTTR (av: ТсLr9, ТсLr19, ТсLr24, ТсLr26) были общими для омской и североказахстанской популяций, а THPTR (av: ТсLr9, ТсLr11, ТсLr19, ТсLr24) и TCTTQ (av: ТсLr9, ТсLr16, ТсLr19, ТсLr20, ТсLr24) – для омской и челябинской. Определено высокое генетическое сходство омской популяции с североказахстанской и челябинской и умеренное между челябинской и североказахстанской популяциями. Распространенность возбудителя темно-бурой листовой пятнистости в Омской области была выше, чем в Челябинской. Из североказахстанских инфекционных образцов листьев С. sativus не выделен. Возбудитель желтой  пятнистости обнаружен во всех  изученных регионах. По признаку токсинообразования среди челябин ских изолятов P. tritici-repentis выявлено пять рас (р1 (PtrToxA, PtrToxС); р2 (PtrToxA); р7 (PtrToxA, PtrToxВ), р8 (PtrToxA, PtrToxВ, PtrToxС); р4 (не образует токсины)); среди омских – три (р1, р2, р3); среди североказахстанских – четыре (р1, р2, р3, р4). 26 фенотипов P. tritici-repentis выявлено при анализе вирулентности на 11 сортах-дифференциаторах. Два из них были представлены во всех популяциях; два – в челябинской и североказахстанской; один – в омской и челябинской; остальные были оригинальными. Высокая степень сходства структуры популяций облигатного патогена P. triticina и сапротрофного P. tritici-repentis в западно азиатских областях Российской Федерации и Северном  Казахстане указывает на единую эпидемиологическую зону. Наличие общих фенотипов патогенов свидетельствует о возможном генном потоке между изученными популяциями, что следует учитывать при размещении в этих регионах генетически защищенных сортов яровой пшеницы.

370-378 109
Аннотация
На территории пустыни Бадаин Жаран (Алашаньское нагорье, западная часть Внутренней Монголии – Китай) расположены многочисленные малоизученные содовые и соленые озера. Исследованные содово-соленые озера характеризуются высокими значениями рН (больше 9) и минерализации (до 400 г/л), что создает условия для развития алкалогалофильного микробного сообщества. Целью настоящей работы было выделение и изучение чистых культур алкалогалофильных микроорганизмов в озерах  пустыни  Бадаин Жаран. Из накопительных культур корковой соли и микробных матов трех озер были выделены и описаны чистые культуры микроорганизмов, принадлежащих к семейству Bacillaceae (филум Firmicutes). С помощью биохимических методов определены эколого-физиологические свойства бактерий. Изоляты проявляют свойства алкалофилов и облигатных алкалофилов, развиваются при уровне рН от 7 до 10.5 (оптимум pH 9–10). По отношению к концентрации NaCl штаммы проявили свойства облигатных и экстремальных галофилов. По отношению к температуре выделенные микроорганизмы представляют собой мезофилы с диапазоном роста от 10 до 50 °С (оптимальный рост в пределах 30–40 °С). В отношении используемых субстратов выделенные культуры отличаются широкой метаболической активностью и, предположительно, в естественных условиях местообитания являются активными деструкторами органического вещества. Для изучения гидрохимических показателей воды применяли атомно-эмиссионную спектрометрию с индуктивно связанной плазмой, ионную хроматографию и капиллярный электрофорез. В результате исследований обнаружено: по многокомпонентному составу в  содово- соленых озерах пустыни Бадаин Жаран доминируют катион натрия и анионы карбоната, бикарбоната хлора и сульфата. Полученные результаты расширяют представления о разнообразии и экологическом значении бактерий в экстремальных природных экосистемах пустыни Бадаин Жаран. Выделенные штаммы представляют интерес для биотехнологии как продуценты ферментов, устойчивых к высоким значениям рН и минерализации.
379-385 119
Аннотация

Заразиха подсолнечниковая – паразитическое бесхлорофилльное растение, поражающее корневую систему растения-хозяина, поглощающее из нее воду, питательные вещества и выделяющее токсичные продукты обмена. Прорастание семян заразихи происходит благодаря стриголактонам, выделяемым в почву корнями подсолнечника, которые привлекают арбускулярные  микоризные грибы (АМ-грибы). Стриголактоны являются веществами «голода» растений и относятся к новому классу фитогормонов, участвующих во многих физиологических процессах, в том числе в регулировании доступности питательных веществ корнями. У заразихи был идентифицирован специфичный рецептор KARRIKIN INSENSITIVE2 DIVERGENT (KAI2d), который участвует в дифференцированном распознавании корневых экссудатов подсолнечни - ка. В геноме паразита установлено несколько генов KAI2d, кодирующих рецепторы KAI2d. В связи с открытием перечисленных веществ обсуждаются новые стратегии защиты подсолнечника от заразихи, которые находятся на стадии разработки. На основе стриголактонов создан синтетический препарат GR24 и его аналоги с целью внесения их в почву для стимулирования прорастания семян заразихи. Аминокислота метионин сильно ингибирует раннее развитие заразихи без фитотоксичного эффекта у подсолнечника. Семена заразихи хуже распознают корни подсолнечника, которые колонизированы АМ-грибами, бактериями Rhizobium leguminosarum, Azospirillum brasilense, из-за изменения состава корневых экссудатов в колонизированных растениях.  Большой интерес среди синтезированных элиситоров представляет ацибензолар-S-метил. Он вызывает системную устойчивость к бактери альным, грибным и вирусным болезням, индуцирует синтез PR-белков, а также активизирует защитные реакции подсолнечника на внедрение заразихи и приводит к одревеснению эндодермы и торможению проникновения гаусторий семян заразихи через клеточную стенку клеток корня.

БИОРЕСУРСНЫЕ КОЛЛЕКЦИИ

386-393 129
Аннотация

При изучении живого разнообразия большую роль играют биоресурсные коллекции – систематизированные хранилища биологического материала в любых комбинациях и формах. Содержимое коллекций, как правило, формировалось в течение нескольких сотен лет и описывает огромное количество образцов, исчисляемое миллиардами. Большие усилия направлены на сохранение этого материала, а также получение новых образцов. Российская Федерация занимает огромную территорию суши, имеет протяженную береговую линию и богатые природные ресурсы, разнообразие природно­экологических зон. В связи c этим ее территория является уникальной для сбора материала биологических коллекций. В настоящее время в России развивается большое количество биоресурсных коллекций (БРК), однако существует ряд трудностей, связанных, прежде всего, с отсутствием единого информационного ресурса по таким коллекциям. В целях развития научной инфраструктуры Федеральное агентство научных организаций (ФАНО России) проводит работу по формированию единых подходов к использованию существующих БРК и созданию единой информационной системы для их поддержки. В статье представлены результаты разработки информационного портала, призванного обеспечить унифицированные методы работы по всем БРК организаций ФАНО России – ввод, хранение, актуализацию и разграниченный доступ к специфической информации о единицах хранения и их характеристиках. Информационная система «Биоресурсные коллекции научных организаций» (ИС БРК) разработана в виде Интернет­портала (www.biores.cytogen.ru), интегрирующего базы данных (БД) биоресурсных коллекций ФАНО России и графический интерфейс пользователя. Управление доступом к базам данных, интегрируемым в ИС БРК, осуществляется через программный интерфейс для просмотра записей, их создания и редактирования на основе технологии REST. Графический интерфейс пользователя предоставляет следующие возможности в соответствии с правами доступа к БД БРК: авторизованный доступ; просмотр записей; редактирование записей; создание и удаление записей; статистический анализ данных; генерация сводных отчетов; экспорт содержимого записей в формате PDF/RTF/JSON. Графический интерфейс пользователя реализован с применением инструментария и библиотек DRUPAL 7.0. Архитектурно портал представляет собой центральный узел с серией модулей, взаимодействующих через унифицированные программные интерфейсы. Таким образом решается задача подключения новых источников данных (баз коллекций), реализованных на разных системах управления базами данных. С учетом того что в настоящее время многие организации поддерживают доступ к каталогам своих коллекций самостоятельно, на портале указываются внешние ссылки на эти ресурсы. В то же время часть информации по коллекциям хранится в базах данных портала БРК ФАНО России в унифицированных форматах. Портал содержит следующие функциональные разделы: главная страница с общей информацией по биоресурсным коллекциям; каталог коллекций; индивидуальные страницы отдельных коллекций с их описанием (информация о кураторе; статистическая информация о числе единиц хранения в коллекции и числе публикаций, а также ссылка на каталог единиц хранения данной БРК). В настоящее время портал содержит описание более чем 13 тыс. единиц хранения 65 биоресурсных коллекций организаций ФАНО России, ведется его активное наполнение.



Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2500-0462 (Print)
ISSN 2500-3259 (Online)